Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q1

Dnah12, Dynein heavy chain 12, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 3,086 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah12Q3V0Q1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dnah12Q3V0Q1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dnah12Q3V0Q1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dnah12Q3V0Q1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dnah12Q3V0Q1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dnah12Q3V0Q1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dnah12Q3V0Q1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dnah12Q3V0Q1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dnah12Q3V0Q1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dnah12Q3V0Q1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dnah12Q3V0Q1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dnah12Q3V0Q1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dnah12Q3V0Q1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dnah12Q3V0Q1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dnah12Q3V0Q1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dnah12Q3V0Q1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dnah12Q3V0Q1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dnah12Q3V0Q1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dnah12Q3V0Q1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dnah12Q3V0Q1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dnah12Q3V0Q1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dnah12Q3V0Q1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dnah12Q3V0Q1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dnah12Q3V0Q1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dnah12Q3V0Q1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dnah12Q3V0Q1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Dnah12Q3V0Q1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dnah12Q3V0Q1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Dnah12Q3V0Q1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dnah12Q3V0Q1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dnah12Q3V0Q1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dnah12Q3V0Q1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dnah12Q3V0Q1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dnah12Q3V0Q1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Dnah12Q3V0Q1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dnah12Q3V0Q1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dnah12Q3V0Q1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dnah12Q3V0Q1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dnah12Q3V0Q1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dnah12Q3V0Q1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dnah12Q3V0Q1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dnah12Q3V0Q1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dnah12Q3V0Q1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dnah12Q3V0Q1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dnah12Q3V0Q1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dnah12Q3V0Q1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dnah12Q3V0Q1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dnah12Q3V0Q1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dnah12Q3V0Q1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dnah12Q3V0Q1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dnah12Q3V0Q1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dnah12Q3V0Q1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dnah12Q3V0Q1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dnah12Q3V0Q1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dnah12Q3V0Q1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dnah12Q3V0Q1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dnah12Q3V0Q1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Dnah12Q3V0Q1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dnah12Q3V0Q1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dnah12Q3V0Q1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dnah12Q3V0Q1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dnah12Q3V0Q1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dnah12Q3V0Q1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dnah12Q3V0Q1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dnah12Q3V0Q1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dnah12Q3V0Q1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dnah12Q3V0Q1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dnah12Q3V0Q1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dnah12Q3V0Q1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnah12Q3V0Q1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnah12Q3V0Q1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnah12Q3V0Q1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnah12Q3V0Q1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnah12Q3V0Q1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnah12Q3V0Q1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnah12Q3V0Q1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnah12Q3V0Q1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnah12Q3V0Q1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnah12Q3V0Q1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnah12Q3V0Q1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnah12Q3V0Q1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnah12Q3V0Q1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnah12Q3V0Q1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dnah12Q3V0Q1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dnah12Q3V0Q1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dnah12Q3V0Q1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dnah12Q3V0Q1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnah12Q3V0Q1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnah12Q3V0Q1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnah12Q3V0Q1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnah12Q3V0Q1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnah12Q3V0Q1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnah12Q3V0Q1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnah12Q3V0Q1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnah12Q3V0Q1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnah12Q3V0Q1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnah12Q3V0Q1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnah12Q3V0Q1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dnah12Q3V0Q1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dnah12Q3V0Q1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms