Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C1

Zmat1, Zinc finger matrin-type protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zmat1Q3V0C1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zmat1Q3V0C1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zmat1Q3V0C1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zmat1Q3V0C1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zmat1Q3V0C1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zmat1Q3V0C1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zmat1Q3V0C1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zmat1Q3V0C1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zmat1Q3V0C1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zmat1Q3V0C1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Zmat1Q3V0C1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zmat1Q3V0C1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zmat1Q3V0C1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zmat1Q3V0C1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zmat1Q3V0C1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zmat1Q3V0C1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zmat1Q3V0C1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zmat1Q3V0C1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zmat1Q3V0C1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zmat1Q3V0C1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zmat1Q3V0C1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zmat1Q3V0C1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zmat1Q3V0C1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zmat1Q3V0C1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zmat1Q3V0C1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Zmat1Q3V0C1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zmat1Q3V0C1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zmat1Q3V0C1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zmat1Q3V0C1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zmat1Q3V0C1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zmat1Q3V0C1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zmat1Q3V0C1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zmat1Q3V0C1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zmat1Q3V0C1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zmat1Q3V0C1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zmat1Q3V0C1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zmat1Q3V0C1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zmat1Q3V0C1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zmat1Q3V0C1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zmat1Q3V0C1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zmat1Q3V0C1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zmat1Q3V0C1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zmat1Q3V0C1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zmat1Q3V0C1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zmat1Q3V0C1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zmat1Q3V0C1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zmat1Q3V0C1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zmat1Q3V0C1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zmat1Q3V0C1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zmat1Q3V0C1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zmat1Q3V0C1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zmat1Q3V0C1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zmat1Q3V0C1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zmat1Q3V0C1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zmat1Q3V0C1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zmat1Q3V0C1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zmat1Q3V0C1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zmat1Q3V0C1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zmat1Q3V0C1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zmat1Q3V0C1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zmat1Q3V0C1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zmat1Q3V0C1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zmat1Q3V0C1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Zmat1Q3V0C1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Zmat1Q3V0C1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zmat1Q3V0C1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zmat1Q3V0C1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Zmat1Q3V0C1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zmat1Q3V0C1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Zmat1Q3V0C1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zmat1Q3V0C1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zmat1Q3V0C1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zmat1Q3V0C1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zmat1Q3V0C1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zmat1Q3V0C1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zmat1Q3V0C1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zmat1Q3V0C1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zmat1Q3V0C1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zmat1Q3V0C1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zmat1Q3V0C1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zmat1Q3V0C1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zmat1Q3V0C1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zmat1Q3V0C1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Zmat1Q3V0C1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zmat1Q3V0C1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zmat1Q3V0C1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zmat1Q3V0C1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zmat1Q3V0C1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zmat1Q3V0C1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zmat1Q3V0C1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zmat1Q3V0C1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zmat1Q3V0C1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zmat1Q3V0C1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zmat1Q3V0C1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zmat1Q3V0C1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zmat1Q3V0C1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zmat1Q3V0C1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zmat1Q3V0C1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zmat1Q3V0C1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zmat1Q3V0C1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
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