Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXB0

Mbd3l2, Methyl-CpG-binding domain protein 3-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3l2Q3UXB0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd3l2Q3UXB0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd3l2Q3UXB0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd3l2Q3UXB0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd3l2Q3UXB0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd3l2Q3UXB0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd3l2Q3UXB0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd3l2Q3UXB0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd3l2Q3UXB0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd3l2Q3UXB0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd3l2Q3UXB0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd3l2Q3UXB0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd3l2Q3UXB0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd3l2Q3UXB0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd3l2Q3UXB0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd3l2Q3UXB0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Mbd3l2Q3UXB0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mbd3l2Q3UXB0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mbd3l2Q3UXB0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mbd3l2Q3UXB0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mbd3l2Q3UXB0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mbd3l2Q3UXB0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mbd3l2Q3UXB0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mbd3l2Q3UXB0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mbd3l2Q3UXB0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd3l2Q3UXB0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd3l2Q3UXB0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd3l2Q3UXB0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd3l2Q3UXB0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd3l2Q3UXB0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd3l2Q3UXB0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd3l2Q3UXB0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd3l2Q3UXB0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd3l2Q3UXB0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd3l2Q3UXB0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd3l2Q3UXB0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd3l2Q3UXB0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd3l2Q3UXB0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd3l2Q3UXB0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd3l2Q3UXB0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd3l2Q3UXB0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd3l2Q3UXB0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd3l2Q3UXB0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd3l2Q3UXB0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd3l2Q3UXB0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd3l2Q3UXB0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd3l2Q3UXB0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd3l2Q3UXB0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd3l2Q3UXB0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd3l2Q3UXB0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd3l2Q3UXB0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd3l2Q3UXB0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mbd3l2Q3UXB0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mbd3l2Q3UXB0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mbd3l2Q3UXB0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Mbd3l2Q3UXB0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mbd3l2Q3UXB0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mbd3l2Q3UXB0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mbd3l2Q3UXB0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mbd3l2Q3UXB0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd3l2Q3UXB0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd3l2Q3UXB0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd3l2Q3UXB0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd3l2Q3UXB0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd3l2Q3UXB0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd3l2Q3UXB0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd3l2Q3UXB0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mbd3l2Q3UXB0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mbd3l2Q3UXB0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mbd3l2Q3UXB0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mbd3l2Q3UXB0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mbd3l2Q3UXB0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mbd3l2Q3UXB0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Mbd3l2Q3UXB0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mbd3l2Q3UXB0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mbd3l2Q3UXB0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mbd3l2Q3UXB0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd3l2Q3UXB0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd3l2Q3UXB0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd3l2Q3UXB0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd3l2Q3UXB0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd3l2Q3UXB0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd3l2Q3UXB0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd3l2Q3UXB0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd3l2Q3UXB0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd3l2Q3UXB0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd3l2Q3UXB0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms