Protein–RNA interactions for Protein: Q3URS9

Ccdc51, Coiled-coil domain-containing protein 51, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc51Q3URS9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc51Q3URS9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc51Q3URS9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc51Q3URS9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc51Q3URS9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc51Q3URS9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc51Q3URS9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc51Q3URS9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc51Q3URS9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc51Q3URS9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc51Q3URS9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc51Q3URS9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc51Q3URS9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc51Q3URS9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc51Q3URS9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc51Q3URS9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc51Q3URS9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc51Q3URS9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc51Q3URS9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc51Q3URS9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc51Q3URS9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc51Q3URS9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc51Q3URS9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc51Q3URS9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc51Q3URS9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc51Q3URS9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc51Q3URS9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc51Q3URS9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc51Q3URS9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc51Q3URS9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc51Q3URS9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc51Q3URS9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc51Q3URS9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc51Q3URS9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc51Q3URS9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc51Q3URS9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc51Q3URS9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc51Q3URS9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc51Q3URS9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc51Q3URS9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc51Q3URS9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc51Q3URS9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc51Q3URS9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc51Q3URS9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc51Q3URS9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc51Q3URS9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc51Q3URS9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc51Q3URS9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc51Q3URS9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc51Q3URS9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc51Q3URS9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc51Q3URS9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc51Q3URS9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc51Q3URS9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc51Q3URS9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc51Q3URS9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc51Q3URS9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc51Q3URS9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc51Q3URS9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc51Q3URS9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc51Q3URS9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc51Q3URS9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc51Q3URS9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc51Q3URS9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc51Q3URS9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc51Q3URS9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc51Q3URS9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc51Q3URS9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc51Q3URS9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc51Q3URS9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc51Q3URS9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc51Q3URS9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc51Q3URS9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc51Q3URS9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc51Q3URS9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc51Q3URS9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc51Q3URS9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc51Q3URS9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc51Q3URS9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc51Q3URS9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc51Q3URS9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc51Q3URS9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc51Q3URS9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc51Q3URS9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc51Q3URS9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc51Q3URS9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc51Q3URS9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc51Q3URS9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc51Q3URS9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc51Q3URS9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc51Q3URS9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc51Q3URS9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc51Q3URS9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc51Q3URS9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc51Q3URS9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc51Q3URS9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc51Q3URS9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc51Q3URS9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc51Q3URS9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc51Q3URS9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms