Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQI9

Mindy4, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-4, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy4Q3UQI9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mindy4Q3UQI9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mindy4Q3UQI9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mindy4Q3UQI9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mindy4Q3UQI9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mindy4Q3UQI9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mindy4Q3UQI9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mindy4Q3UQI9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mindy4Q3UQI9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mindy4Q3UQI9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mindy4Q3UQI9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mindy4Q3UQI9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mindy4Q3UQI9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mindy4Q3UQI9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mindy4Q3UQI9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mindy4Q3UQI9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mindy4Q3UQI9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mindy4Q3UQI9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mindy4Q3UQI9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mindy4Q3UQI9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mindy4Q3UQI9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mindy4Q3UQI9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mindy4Q3UQI9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mindy4Q3UQI9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mindy4Q3UQI9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mindy4Q3UQI9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mindy4Q3UQI9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mindy4Q3UQI9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mindy4Q3UQI9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mindy4Q3UQI9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mindy4Q3UQI9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mindy4Q3UQI9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mindy4Q3UQI9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mindy4Q3UQI9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mindy4Q3UQI9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mindy4Q3UQI9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mindy4Q3UQI9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mindy4Q3UQI9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mindy4Q3UQI9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mindy4Q3UQI9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mindy4Q3UQI9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mindy4Q3UQI9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mindy4Q3UQI9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mindy4Q3UQI9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mindy4Q3UQI9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mindy4Q3UQI9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mindy4Q3UQI9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mindy4Q3UQI9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mindy4Q3UQI9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mindy4Q3UQI9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mindy4Q3UQI9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mindy4Q3UQI9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mindy4Q3UQI9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mindy4Q3UQI9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mindy4Q3UQI9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mindy4Q3UQI9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mindy4Q3UQI9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mindy4Q3UQI9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mindy4Q3UQI9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mindy4Q3UQI9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mindy4Q3UQI9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mindy4Q3UQI9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Mindy4Q3UQI9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Mindy4Q3UQI9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mindy4Q3UQI9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mindy4Q3UQI9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mindy4Q3UQI9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mindy4Q3UQI9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mindy4Q3UQI9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mindy4Q3UQI9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mindy4Q3UQI9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Mindy4Q3UQI9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mindy4Q3UQI9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mindy4Q3UQI9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mindy4Q3UQI9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mindy4Q3UQI9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mindy4Q3UQI9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mindy4Q3UQI9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mindy4Q3UQI9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mindy4Q3UQI9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mindy4Q3UQI9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mindy4Q3UQI9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mindy4Q3UQI9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mindy4Q3UQI9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Mindy4Q3UQI9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mindy4Q3UQI9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mindy4Q3UQI9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mindy4Q3UQI9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mindy4Q3UQI9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mindy4Q3UQI9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mindy4Q3UQI9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mindy4Q3UQI9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Mindy4Q3UQI9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mindy4Q3UQI9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mindy4Q3UQI9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mindy4Q3UQI9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mindy4Q3UQI9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mindy4Q3UQI9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mindy4Q3UQI9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mindy4Q3UQI9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms