Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
E130208F15RikQ3UPV3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
E130208F15RikQ3UPV3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
E130208F15RikQ3UPV3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
E130208F15RikQ3UPV3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
E130208F15RikQ3UPV3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
E130208F15RikQ3UPV3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
E130208F15RikQ3UPV3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
E130208F15RikQ3UPV3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
E130208F15RikQ3UPV3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
E130208F15RikQ3UPV3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
E130208F15RikQ3UPV3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
E130208F15RikQ3UPV3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
E130208F15RikQ3UPV3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
E130208F15RikQ3UPV3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
E130208F15RikQ3UPV3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
E130208F15RikQ3UPV3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
E130208F15RikQ3UPV3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
E130208F15RikQ3UPV3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
E130208F15RikQ3UPV3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
E130208F15RikQ3UPV3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
E130208F15RikQ3UPV3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
E130208F15RikQ3UPV3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
E130208F15RikQ3UPV3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
E130208F15RikQ3UPV3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
E130208F15RikQ3UPV3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
E130208F15RikQ3UPV3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
E130208F15RikQ3UPV3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
E130208F15RikQ3UPV3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
E130208F15RikQ3UPV3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
E130208F15RikQ3UPV3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
E130208F15RikQ3UPV3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
E130208F15RikQ3UPV3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
E130208F15RikQ3UPV3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
E130208F15RikQ3UPV3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
E130208F15RikQ3UPV3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
E130208F15RikQ3UPV3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
E130208F15RikQ3UPV3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
E130208F15RikQ3UPV3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
E130208F15RikQ3UPV3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
E130208F15RikQ3UPV3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
E130208F15RikQ3UPV3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
E130208F15RikQ3UPV3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
E130208F15RikQ3UPV3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
E130208F15RikQ3UPV3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
E130208F15RikQ3UPV3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
E130208F15RikQ3UPV3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
E130208F15RikQ3UPV3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
E130208F15RikQ3UPV3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
E130208F15RikQ3UPV3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms