Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP38

Cracr2a, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2aQ3UP38 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cracr2aQ3UP38 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cracr2aQ3UP38 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cracr2aQ3UP38 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cracr2aQ3UP38 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cracr2aQ3UP38 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cracr2aQ3UP38 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cracr2aQ3UP38 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cracr2aQ3UP38 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cracr2aQ3UP38 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cracr2aQ3UP38 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cracr2aQ3UP38 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cracr2aQ3UP38 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cracr2aQ3UP38 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cracr2aQ3UP38 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cracr2aQ3UP38 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cracr2aQ3UP38 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cracr2aQ3UP38 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cracr2aQ3UP38 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cracr2aQ3UP38 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cracr2aQ3UP38 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cracr2aQ3UP38 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cracr2aQ3UP38 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cracr2aQ3UP38 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cracr2aQ3UP38 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cracr2aQ3UP38 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cracr2aQ3UP38 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cracr2aQ3UP38 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cracr2aQ3UP38 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cracr2aQ3UP38 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cracr2aQ3UP38 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cracr2aQ3UP38 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cracr2aQ3UP38 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cracr2aQ3UP38 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cracr2aQ3UP38 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cracr2aQ3UP38 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cracr2aQ3UP38 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cracr2aQ3UP38 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cracr2aQ3UP38 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cracr2aQ3UP38 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cracr2aQ3UP38 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cracr2aQ3UP38 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cracr2aQ3UP38 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cracr2aQ3UP38 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cracr2aQ3UP38 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cracr2aQ3UP38 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cracr2aQ3UP38 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cracr2aQ3UP38 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cracr2aQ3UP38 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cracr2aQ3UP38 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cracr2aQ3UP38 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cracr2aQ3UP38 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cracr2aQ3UP38 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cracr2aQ3UP38 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cracr2aQ3UP38 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cracr2aQ3UP38 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cracr2aQ3UP38 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cracr2aQ3UP38 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cracr2aQ3UP38 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cracr2aQ3UP38 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cracr2aQ3UP38 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cracr2aQ3UP38 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cracr2aQ3UP38 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cracr2aQ3UP38 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cracr2aQ3UP38 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cracr2aQ3UP38 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cracr2aQ3UP38 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cracr2aQ3UP38 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cracr2aQ3UP38 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cracr2aQ3UP38 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cracr2aQ3UP38 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cracr2aQ3UP38 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cracr2aQ3UP38 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cracr2aQ3UP38 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cracr2aQ3UP38 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cracr2aQ3UP38 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cracr2aQ3UP38 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cracr2aQ3UP38 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cracr2aQ3UP38 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cracr2aQ3UP38 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cracr2aQ3UP38 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cracr2aQ3UP38 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cracr2aQ3UP38 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cracr2aQ3UP38 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cracr2aQ3UP38 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Cracr2aQ3UP38 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cracr2aQ3UP38 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cracr2aQ3UP38 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cracr2aQ3UP38 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cracr2aQ3UP38 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cracr2aQ3UP38 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cracr2aQ3UP38 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cracr2aQ3UP38 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cracr2aQ3UP38 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cracr2aQ3UP38 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cracr2aQ3UP38 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cracr2aQ3UP38 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cracr2aQ3UP38 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cracr2aQ3UP38 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cracr2aQ3UP38 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms