Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Skap2Q3UND0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Skap2Q3UND0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Skap2Q3UND0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Skap2Q3UND0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Skap2Q3UND0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Skap2Q3UND0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Skap2Q3UND0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Skap2Q3UND0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Skap2Q3UND0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Skap2Q3UND0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Skap2Q3UND0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Skap2Q3UND0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Skap2Q3UND0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Skap2Q3UND0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Skap2Q3UND0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Skap2Q3UND0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Skap2Q3UND0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Skap2Q3UND0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Skap2Q3UND0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Skap2Q3UND0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Skap2Q3UND0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Skap2Q3UND0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Skap2Q3UND0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Skap2Q3UND0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Skap2Q3UND0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Skap2Q3UND0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Skap2Q3UND0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Skap2Q3UND0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Skap2Q3UND0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Skap2Q3UND0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Skap2Q3UND0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Skap2Q3UND0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Skap2Q3UND0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Skap2Q3UND0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Skap2Q3UND0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Skap2Q3UND0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Skap2Q3UND0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Skap2Q3UND0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Skap2Q3UND0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Skap2Q3UND0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Skap2Q3UND0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Skap2Q3UND0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Skap2Q3UND0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Skap2Q3UND0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Skap2Q3UND0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Skap2Q3UND0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Skap2Q3UND0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Skap2Q3UND0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Skap2Q3UND0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Skap2Q3UND0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Skap2Q3UND0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Skap2Q3UND0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Skap2Q3UND0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Skap2Q3UND0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Skap2Q3UND0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Skap2Q3UND0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Skap2Q3UND0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Skap2Q3UND0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Skap2Q3UND0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Skap2Q3UND0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Skap2Q3UND0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Skap2Q3UND0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Skap2Q3UND0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Skap2Q3UND0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Skap2Q3UND0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Skap2Q3UND0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Skap2Q3UND0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Skap2Q3UND0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Skap2Q3UND0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Skap2Q3UND0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Skap2Q3UND0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Skap2Q3UND0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Skap2Q3UND0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Skap2Q3UND0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Skap2Q3UND0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Skap2Q3UND0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Skap2Q3UND0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Skap2Q3UND0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Skap2Q3UND0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Skap2Q3UND0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Skap2Q3UND0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Skap2Q3UND0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Skap2Q3UND0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Skap2Q3UND0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Skap2Q3UND0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Skap2Q3UND0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Skap2Q3UND0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Skap2Q3UND0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Skap2Q3UND0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Skap2Q3UND0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Skap2Q3UND0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Skap2Q3UND0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Skap2Q3UND0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Skap2Q3UND0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Skap2Q3UND0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Skap2Q3UND0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Skap2Q3UND0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Skap2Q3UND0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Skap2Q3UND0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms