Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMW8

Cln5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln5Q3UMW8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cln5Q3UMW8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cln5Q3UMW8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cln5Q3UMW8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cln5Q3UMW8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cln5Q3UMW8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cln5Q3UMW8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cln5Q3UMW8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cln5Q3UMW8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cln5Q3UMW8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cln5Q3UMW8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cln5Q3UMW8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cln5Q3UMW8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cln5Q3UMW8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cln5Q3UMW8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cln5Q3UMW8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cln5Q3UMW8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cln5Q3UMW8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cln5Q3UMW8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cln5Q3UMW8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cln5Q3UMW8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cln5Q3UMW8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cln5Q3UMW8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cln5Q3UMW8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cln5Q3UMW8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cln5Q3UMW8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cln5Q3UMW8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cln5Q3UMW8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cln5Q3UMW8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cln5Q3UMW8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cln5Q3UMW8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cln5Q3UMW8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cln5Q3UMW8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cln5Q3UMW8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cln5Q3UMW8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cln5Q3UMW8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cln5Q3UMW8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cln5Q3UMW8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cln5Q3UMW8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cln5Q3UMW8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cln5Q3UMW8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cln5Q3UMW8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cln5Q3UMW8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cln5Q3UMW8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cln5Q3UMW8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cln5Q3UMW8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cln5Q3UMW8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cln5Q3UMW8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cln5Q3UMW8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cln5Q3UMW8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cln5Q3UMW8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cln5Q3UMW8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cln5Q3UMW8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cln5Q3UMW8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cln5Q3UMW8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cln5Q3UMW8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cln5Q3UMW8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cln5Q3UMW8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cln5Q3UMW8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cln5Q3UMW8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cln5Q3UMW8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cln5Q3UMW8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cln5Q3UMW8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cln5Q3UMW8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cln5Q3UMW8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cln5Q3UMW8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cln5Q3UMW8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cln5Q3UMW8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cln5Q3UMW8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
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Cln5Q3UMW8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cln5Q3UMW8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cln5Q3UMW8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cln5Q3UMW8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cln5Q3UMW8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cln5Q3UMW8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cln5Q3UMW8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cln5Q3UMW8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cln5Q3UMW8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cln5Q3UMW8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cln5Q3UMW8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cln5Q3UMW8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cln5Q3UMW8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cln5Q3UMW8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cln5Q3UMW8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cln5Q3UMW8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cln5Q3UMW8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cln5Q3UMW8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cln5Q3UMW8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cln5Q3UMW8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cln5Q3UMW8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cln5Q3UMW8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cln5Q3UMW8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cln5Q3UMW8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cln5Q3UMW8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cln5Q3UMW8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cln5Q3UMW8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cln5Q3UMW8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cln5Q3UMW8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cln5Q3UMW8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms