Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cog7Q3UM29 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cog7Q3UM29 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cog7Q3UM29 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cog7Q3UM29 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cog7Q3UM29 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cog7Q3UM29 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cog7Q3UM29 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cog7Q3UM29 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cog7Q3UM29 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cog7Q3UM29 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cog7Q3UM29 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cog7Q3UM29 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cog7Q3UM29 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cog7Q3UM29 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cog7Q3UM29 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cog7Q3UM29 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cog7Q3UM29 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cog7Q3UM29 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cog7Q3UM29 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cog7Q3UM29 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cog7Q3UM29 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cog7Q3UM29 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cog7Q3UM29 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cog7Q3UM29 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cog7Q3UM29 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cog7Q3UM29 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cog7Q3UM29 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cog7Q3UM29 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cog7Q3UM29 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Cog7Q3UM29 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cog7Q3UM29 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cog7Q3UM29 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cog7Q3UM29 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cog7Q3UM29 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cog7Q3UM29 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cog7Q3UM29 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cog7Q3UM29 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cog7Q3UM29 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cog7Q3UM29 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cog7Q3UM29 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cog7Q3UM29 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Cog7Q3UM29 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cog7Q3UM29 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cog7Q3UM29 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cog7Q3UM29 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cog7Q3UM29 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cog7Q3UM29 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cog7Q3UM29 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cog7Q3UM29 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cog7Q3UM29 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cog7Q3UM29 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cog7Q3UM29 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cog7Q3UM29 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cog7Q3UM29 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cog7Q3UM29 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cog7Q3UM29 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cog7Q3UM29 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cog7Q3UM29 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cog7Q3UM29 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cog7Q3UM29 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cog7Q3UM29 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cog7Q3UM29 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cog7Q3UM29 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cog7Q3UM29 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cog7Q3UM29 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cog7Q3UM29 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cog7Q3UM29 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cog7Q3UM29 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cog7Q3UM29 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cog7Q3UM29 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cog7Q3UM29 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cog7Q3UM29 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cog7Q3UM29 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cog7Q3UM29 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cog7Q3UM29 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cog7Q3UM29 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cog7Q3UM29 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cog7Q3UM29 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cog7Q3UM29 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cog7Q3UM29 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cog7Q3UM29 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cog7Q3UM29 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cog7Q3UM29 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cog7Q3UM29 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cog7Q3UM29 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cog7Q3UM29 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cog7Q3UM29 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cog7Q3UM29 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cog7Q3UM29 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cog7Q3UM29 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cog7Q3UM29 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cog7Q3UM29 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cog7Q3UM29 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cog7Q3UM29 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cog7Q3UM29 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cog7Q3UM29 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cog7Q3UM29 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cog7Q3UM29 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cog7Q3UM29 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 164 ms