Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKJ7

Smu1, WD40 repeat-containing protein SMU1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 513 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smu1Q3UKJ7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smu1Q3UKJ7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smu1Q3UKJ7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smu1Q3UKJ7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smu1Q3UKJ7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smu1Q3UKJ7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smu1Q3UKJ7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smu1Q3UKJ7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smu1Q3UKJ7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smu1Q3UKJ7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smu1Q3UKJ7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Smu1Q3UKJ7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smu1Q3UKJ7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smu1Q3UKJ7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smu1Q3UKJ7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smu1Q3UKJ7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smu1Q3UKJ7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Smu1Q3UKJ7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smu1Q3UKJ7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smu1Q3UKJ7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Smu1Q3UKJ7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smu1Q3UKJ7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smu1Q3UKJ7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Smu1Q3UKJ7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smu1Q3UKJ7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smu1Q3UKJ7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smu1Q3UKJ7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smu1Q3UKJ7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smu1Q3UKJ7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Smu1Q3UKJ7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Smu1Q3UKJ7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smu1Q3UKJ7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smu1Q3UKJ7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smu1Q3UKJ7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smu1Q3UKJ7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smu1Q3UKJ7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smu1Q3UKJ7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smu1Q3UKJ7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Smu1Q3UKJ7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smu1Q3UKJ7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smu1Q3UKJ7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smu1Q3UKJ7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smu1Q3UKJ7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smu1Q3UKJ7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smu1Q3UKJ7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Smu1Q3UKJ7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smu1Q3UKJ7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smu1Q3UKJ7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smu1Q3UKJ7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smu1Q3UKJ7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smu1Q3UKJ7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smu1Q3UKJ7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Smu1Q3UKJ7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smu1Q3UKJ7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smu1Q3UKJ7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smu1Q3UKJ7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smu1Q3UKJ7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smu1Q3UKJ7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smu1Q3UKJ7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smu1Q3UKJ7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smu1Q3UKJ7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smu1Q3UKJ7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smu1Q3UKJ7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smu1Q3UKJ7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smu1Q3UKJ7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smu1Q3UKJ7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smu1Q3UKJ7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smu1Q3UKJ7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smu1Q3UKJ7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Smu1Q3UKJ7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smu1Q3UKJ7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smu1Q3UKJ7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smu1Q3UKJ7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smu1Q3UKJ7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smu1Q3UKJ7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smu1Q3UKJ7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smu1Q3UKJ7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smu1Q3UKJ7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smu1Q3UKJ7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smu1Q3UKJ7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smu1Q3UKJ7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smu1Q3UKJ7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smu1Q3UKJ7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smu1Q3UKJ7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smu1Q3UKJ7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smu1Q3UKJ7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smu1Q3UKJ7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smu1Q3UKJ7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smu1Q3UKJ7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smu1Q3UKJ7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smu1Q3UKJ7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smu1Q3UKJ7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smu1Q3UKJ7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smu1Q3UKJ7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smu1Q3UKJ7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smu1Q3UKJ7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smu1Q3UKJ7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smu1Q3UKJ7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Smu1Q3UKJ7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smu1Q3UKJ7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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