Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJV1

Ccdc61, Coiled-coil domain-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc61Q3UJV1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc61Q3UJV1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc61Q3UJV1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc61Q3UJV1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc61Q3UJV1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc61Q3UJV1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc61Q3UJV1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc61Q3UJV1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc61Q3UJV1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc61Q3UJV1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc61Q3UJV1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc61Q3UJV1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc61Q3UJV1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc61Q3UJV1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc61Q3UJV1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc61Q3UJV1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc61Q3UJV1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc61Q3UJV1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc61Q3UJV1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc61Q3UJV1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc61Q3UJV1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc61Q3UJV1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc61Q3UJV1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc61Q3UJV1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc61Q3UJV1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc61Q3UJV1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc61Q3UJV1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc61Q3UJV1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc61Q3UJV1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc61Q3UJV1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc61Q3UJV1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc61Q3UJV1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc61Q3UJV1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc61Q3UJV1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc61Q3UJV1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc61Q3UJV1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc61Q3UJV1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc61Q3UJV1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc61Q3UJV1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc61Q3UJV1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc61Q3UJV1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc61Q3UJV1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc61Q3UJV1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc61Q3UJV1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc61Q3UJV1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc61Q3UJV1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc61Q3UJV1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc61Q3UJV1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc61Q3UJV1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc61Q3UJV1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc61Q3UJV1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc61Q3UJV1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc61Q3UJV1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc61Q3UJV1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc61Q3UJV1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc61Q3UJV1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc61Q3UJV1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc61Q3UJV1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc61Q3UJV1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc61Q3UJV1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc61Q3UJV1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc61Q3UJV1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc61Q3UJV1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc61Q3UJV1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc61Q3UJV1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc61Q3UJV1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc61Q3UJV1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc61Q3UJV1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc61Q3UJV1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc61Q3UJV1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc61Q3UJV1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc61Q3UJV1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc61Q3UJV1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc61Q3UJV1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc61Q3UJV1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc61Q3UJV1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc61Q3UJV1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc61Q3UJV1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc61Q3UJV1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc61Q3UJV1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc61Q3UJV1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc61Q3UJV1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc61Q3UJV1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc61Q3UJV1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc61Q3UJV1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc61Q3UJV1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc61Q3UJV1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc61Q3UJV1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc61Q3UJV1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc61Q3UJV1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc61Q3UJV1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc61Q3UJV1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc61Q3UJV1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc61Q3UJV1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc61Q3UJV1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc61Q3UJV1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc61Q3UJV1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc61Q3UJV1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc61Q3UJV1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc61Q3UJV1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms