Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJF0

Gpr55, G-protein coupled receptor 55, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr55Q3UJF0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpr55Q3UJF0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpr55Q3UJF0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpr55Q3UJF0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpr55Q3UJF0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpr55Q3UJF0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpr55Q3UJF0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpr55Q3UJF0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpr55Q3UJF0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpr55Q3UJF0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpr55Q3UJF0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpr55Q3UJF0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpr55Q3UJF0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpr55Q3UJF0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpr55Q3UJF0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpr55Q3UJF0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpr55Q3UJF0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpr55Q3UJF0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpr55Q3UJF0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpr55Q3UJF0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpr55Q3UJF0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gpr55Q3UJF0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gpr55Q3UJF0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gpr55Q3UJF0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gpr55Q3UJF0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpr55Q3UJF0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpr55Q3UJF0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpr55Q3UJF0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpr55Q3UJF0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpr55Q3UJF0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpr55Q3UJF0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpr55Q3UJF0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpr55Q3UJF0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpr55Q3UJF0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpr55Q3UJF0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpr55Q3UJF0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpr55Q3UJF0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpr55Q3UJF0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpr55Q3UJF0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpr55Q3UJF0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpr55Q3UJF0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpr55Q3UJF0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpr55Q3UJF0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpr55Q3UJF0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpr55Q3UJF0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpr55Q3UJF0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpr55Q3UJF0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpr55Q3UJF0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpr55Q3UJF0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpr55Q3UJF0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpr55Q3UJF0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpr55Q3UJF0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpr55Q3UJF0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpr55Q3UJF0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpr55Q3UJF0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpr55Q3UJF0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpr55Q3UJF0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpr55Q3UJF0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpr55Q3UJF0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpr55Q3UJF0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpr55Q3UJF0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpr55Q3UJF0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpr55Q3UJF0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpr55Q3UJF0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpr55Q3UJF0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpr55Q3UJF0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpr55Q3UJF0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpr55Q3UJF0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpr55Q3UJF0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpr55Q3UJF0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpr55Q3UJF0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpr55Q3UJF0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpr55Q3UJF0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpr55Q3UJF0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpr55Q3UJF0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpr55Q3UJF0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpr55Q3UJF0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gpr55Q3UJF0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gpr55Q3UJF0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gpr55Q3UJF0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gpr55Q3UJF0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gpr55Q3UJF0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gpr55Q3UJF0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gpr55Q3UJF0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gpr55Q3UJF0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gpr55Q3UJF0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gpr55Q3UJF0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gpr55Q3UJF0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpr55Q3UJF0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpr55Q3UJF0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpr55Q3UJF0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpr55Q3UJF0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpr55Q3UJF0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpr55Q3UJF0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpr55Q3UJF0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpr55Q3UJF0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpr55Q3UJF0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpr55Q3UJF0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpr55Q3UJF0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpr55Q3UJF0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms