Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHN9

Ndst1, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst1Q3UHN9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ndst1Q3UHN9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ndst1Q3UHN9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ndst1Q3UHN9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ndst1Q3UHN9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ndst1Q3UHN9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ndst1Q3UHN9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndst1Q3UHN9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndst1Q3UHN9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndst1Q3UHN9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndst1Q3UHN9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndst1Q3UHN9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndst1Q3UHN9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndst1Q3UHN9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndst1Q3UHN9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndst1Q3UHN9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndst1Q3UHN9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndst1Q3UHN9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndst1Q3UHN9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndst1Q3UHN9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndst1Q3UHN9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndst1Q3UHN9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndst1Q3UHN9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndst1Q3UHN9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ndst1Q3UHN9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ndst1Q3UHN9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ndst1Q3UHN9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ndst1Q3UHN9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ndst1Q3UHN9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ndst1Q3UHN9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ndst1Q3UHN9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ndst1Q3UHN9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ndst1Q3UHN9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ndst1Q3UHN9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ndst1Q3UHN9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ndst1Q3UHN9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ndst1Q3UHN9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ndst1Q3UHN9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ndst1Q3UHN9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ndst1Q3UHN9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ndst1Q3UHN9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ndst1Q3UHN9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ndst1Q3UHN9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ndst1Q3UHN9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ndst1Q3UHN9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ndst1Q3UHN9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ndst1Q3UHN9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ndst1Q3UHN9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ndst1Q3UHN9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ndst1Q3UHN9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ndst1Q3UHN9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ndst1Q3UHN9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ndst1Q3UHN9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ndst1Q3UHN9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ndst1Q3UHN9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ndst1Q3UHN9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ndst1Q3UHN9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ndst1Q3UHN9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ndst1Q3UHN9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ndst1Q3UHN9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ndst1Q3UHN9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ndst1Q3UHN9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ndst1Q3UHN9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ndst1Q3UHN9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ndst1Q3UHN9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ndst1Q3UHN9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ndst1Q3UHN9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ndst1Q3UHN9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ndst1Q3UHN9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ndst1Q3UHN9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ndst1Q3UHN9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ndst1Q3UHN9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ndst1Q3UHN9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ndst1Q3UHN9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ndst1Q3UHN9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ndst1Q3UHN9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ndst1Q3UHN9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ndst1Q3UHN9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ndst1Q3UHN9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ndst1Q3UHN9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ndst1Q3UHN9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ndst1Q3UHN9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ndst1Q3UHN9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ndst1Q3UHN9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ndst1Q3UHN9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ndst1Q3UHN9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ndst1Q3UHN9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ndst1Q3UHN9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ndst1Q3UHN9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ndst1Q3UHN9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ndst1Q3UHN9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ndst1Q3UHN9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ndst1Q3UHN9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ndst1Q3UHN9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ndst1Q3UHN9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ndst1Q3UHN9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ndst1Q3UHN9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ndst1Q3UHN9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ndst1Q3UHN9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ndst1Q3UHN9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms