Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHI0

Ccser2, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser2Q3UHI0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccser2Q3UHI0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccser2Q3UHI0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccser2Q3UHI0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccser2Q3UHI0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccser2Q3UHI0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccser2Q3UHI0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccser2Q3UHI0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccser2Q3UHI0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccser2Q3UHI0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccser2Q3UHI0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccser2Q3UHI0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccser2Q3UHI0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccser2Q3UHI0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccser2Q3UHI0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccser2Q3UHI0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccser2Q3UHI0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccser2Q3UHI0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccser2Q3UHI0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccser2Q3UHI0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccser2Q3UHI0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccser2Q3UHI0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccser2Q3UHI0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccser2Q3UHI0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccser2Q3UHI0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccser2Q3UHI0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccser2Q3UHI0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccser2Q3UHI0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccser2Q3UHI0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccser2Q3UHI0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccser2Q3UHI0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccser2Q3UHI0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccser2Q3UHI0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccser2Q3UHI0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccser2Q3UHI0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccser2Q3UHI0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccser2Q3UHI0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccser2Q3UHI0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccser2Q3UHI0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccser2Q3UHI0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccser2Q3UHI0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccser2Q3UHI0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccser2Q3UHI0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccser2Q3UHI0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccser2Q3UHI0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccser2Q3UHI0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccser2Q3UHI0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccser2Q3UHI0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccser2Q3UHI0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccser2Q3UHI0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccser2Q3UHI0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccser2Q3UHI0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccser2Q3UHI0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccser2Q3UHI0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccser2Q3UHI0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccser2Q3UHI0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccser2Q3UHI0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccser2Q3UHI0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccser2Q3UHI0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccser2Q3UHI0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccser2Q3UHI0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccser2Q3UHI0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccser2Q3UHI0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccser2Q3UHI0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccser2Q3UHI0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccser2Q3UHI0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccser2Q3UHI0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccser2Q3UHI0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccser2Q3UHI0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccser2Q3UHI0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccser2Q3UHI0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccser2Q3UHI0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccser2Q3UHI0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccser2Q3UHI0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccser2Q3UHI0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccser2Q3UHI0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccser2Q3UHI0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccser2Q3UHI0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccser2Q3UHI0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccser2Q3UHI0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccser2Q3UHI0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccser2Q3UHI0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccser2Q3UHI0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccser2Q3UHI0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccser2Q3UHI0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccser2Q3UHI0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccser2Q3UHI0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccser2Q3UHI0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccser2Q3UHI0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccser2Q3UHI0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccser2Q3UHI0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccser2Q3UHI0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccser2Q3UHI0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccser2Q3UHI0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccser2Q3UHI0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccser2Q3UHI0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccser2Q3UHI0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccser2Q3UHI0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccser2Q3UHI0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccser2Q3UHI0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms