Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snx27Q3UHD6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snx27Q3UHD6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx27Q3UHD6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx27Q3UHD6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx27Q3UHD6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx27Q3UHD6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx27Q3UHD6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx27Q3UHD6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx27Q3UHD6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx27Q3UHD6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx27Q3UHD6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx27Q3UHD6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx27Q3UHD6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx27Q3UHD6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx27Q3UHD6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx27Q3UHD6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx27Q3UHD6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx27Q3UHD6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx27Q3UHD6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snx27Q3UHD6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snx27Q3UHD6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snx27Q3UHD6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Snx27Q3UHD6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snx27Q3UHD6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snx27Q3UHD6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snx27Q3UHD6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snx27Q3UHD6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snx27Q3UHD6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx27Q3UHD6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx27Q3UHD6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx27Q3UHD6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx27Q3UHD6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx27Q3UHD6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Snx27Q3UHD6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Snx27Q3UHD6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Snx27Q3UHD6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Snx27Q3UHD6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snx27Q3UHD6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snx27Q3UHD6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snx27Q3UHD6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snx27Q3UHD6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snx27Q3UHD6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snx27Q3UHD6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snx27Q3UHD6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snx27Q3UHD6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx27Q3UHD6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx27Q3UHD6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx27Q3UHD6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx27Q3UHD6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx27Q3UHD6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx27Q3UHD6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx27Q3UHD6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx27Q3UHD6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx27Q3UHD6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snx27Q3UHD6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snx27Q3UHD6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snx27Q3UHD6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snx27Q3UHD6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snx27Q3UHD6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snx27Q3UHD6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snx27Q3UHD6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Snx27Q3UHD6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snx27Q3UHD6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx27Q3UHD6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx27Q3UHD6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx27Q3UHD6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx27Q3UHD6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx27Q3UHD6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx27Q3UHD6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx27Q3UHD6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx27Q3UHD6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx27Q3UHD6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx27Q3UHD6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx27Q3UHD6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx27Q3UHD6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx27Q3UHD6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx27Q3UHD6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx27Q3UHD6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx27Q3UHD6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx27Q3UHD6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snx27Q3UHD6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snx27Q3UHD6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snx27Q3UHD6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snx27Q3UHD6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snx27Q3UHD6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx27Q3UHD6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx27Q3UHD6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx27Q3UHD6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx27Q3UHD6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx27Q3UHD6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx27Q3UHD6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx27Q3UHD6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx27Q3UHD6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx27Q3UHD6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx27Q3UHD6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx27Q3UHD6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx27Q3UHD6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx27Q3UHD6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx27Q3UHD6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms