Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHC1

Rapgef1, Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef1Q3UHC1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rapgef1Q3UHC1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rapgef1Q3UHC1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rapgef1Q3UHC1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rapgef1Q3UHC1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Rapgef1Q3UHC1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rapgef1Q3UHC1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rapgef1Q3UHC1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rapgef1Q3UHC1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rapgef1Q3UHC1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rapgef1Q3UHC1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rapgef1Q3UHC1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rapgef1Q3UHC1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rapgef1Q3UHC1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rapgef1Q3UHC1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rapgef1Q3UHC1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rapgef1Q3UHC1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rapgef1Q3UHC1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rapgef1Q3UHC1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rapgef1Q3UHC1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rapgef1Q3UHC1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rapgef1Q3UHC1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rapgef1Q3UHC1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rapgef1Q3UHC1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rapgef1Q3UHC1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rapgef1Q3UHC1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rapgef1Q3UHC1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rapgef1Q3UHC1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rapgef1Q3UHC1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rapgef1Q3UHC1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rapgef1Q3UHC1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rapgef1Q3UHC1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rapgef1Q3UHC1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rapgef1Q3UHC1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rapgef1Q3UHC1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rapgef1Q3UHC1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rapgef1Q3UHC1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rapgef1Q3UHC1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rapgef1Q3UHC1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rapgef1Q3UHC1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rapgef1Q3UHC1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rapgef1Q3UHC1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rapgef1Q3UHC1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rapgef1Q3UHC1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rapgef1Q3UHC1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rapgef1Q3UHC1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rapgef1Q3UHC1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rapgef1Q3UHC1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rapgef1Q3UHC1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Rapgef1Q3UHC1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Rapgef1Q3UHC1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rapgef1Q3UHC1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rapgef1Q3UHC1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rapgef1Q3UHC1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rapgef1Q3UHC1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rapgef1Q3UHC1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rapgef1Q3UHC1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rapgef1Q3UHC1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rapgef1Q3UHC1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rapgef1Q3UHC1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rapgef1Q3UHC1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rapgef1Q3UHC1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rapgef1Q3UHC1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rapgef1Q3UHC1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rapgef1Q3UHC1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rapgef1Q3UHC1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rapgef1Q3UHC1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rapgef1Q3UHC1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rapgef1Q3UHC1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rapgef1Q3UHC1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rapgef1Q3UHC1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rapgef1Q3UHC1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rapgef1Q3UHC1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rapgef1Q3UHC1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rapgef1Q3UHC1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rapgef1Q3UHC1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Rapgef1Q3UHC1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rapgef1Q3UHC1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rapgef1Q3UHC1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rapgef1Q3UHC1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Rapgef1Q3UHC1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Rapgef1Q3UHC1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rapgef1Q3UHC1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rapgef1Q3UHC1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rapgef1Q3UHC1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rapgef1Q3UHC1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rapgef1Q3UHC1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rapgef1Q3UHC1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rapgef1Q3UHC1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rapgef1Q3UHC1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rapgef1Q3UHC1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rapgef1Q3UHC1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rapgef1Q3UHC1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rapgef1Q3UHC1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rapgef1Q3UHC1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rapgef1Q3UHC1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rapgef1Q3UHC1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rapgef1Q3UHC1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rapgef1Q3UHC1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rapgef1Q3UHC1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
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