Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGS4

Mcrip1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcrip1Q3UGS4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mcrip1Q3UGS4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mcrip1Q3UGS4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mcrip1Q3UGS4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mcrip1Q3UGS4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mcrip1Q3UGS4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mcrip1Q3UGS4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Mcrip1Q3UGS4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mcrip1Q3UGS4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mcrip1Q3UGS4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mcrip1Q3UGS4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mcrip1Q3UGS4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mcrip1Q3UGS4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Mcrip1Q3UGS4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mcrip1Q3UGS4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mcrip1Q3UGS4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mcrip1Q3UGS4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mcrip1Q3UGS4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mcrip1Q3UGS4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mcrip1Q3UGS4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mcrip1Q3UGS4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mcrip1Q3UGS4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mcrip1Q3UGS4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mcrip1Q3UGS4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mcrip1Q3UGS4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mcrip1Q3UGS4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mcrip1Q3UGS4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mcrip1Q3UGS4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mcrip1Q3UGS4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mcrip1Q3UGS4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mcrip1Q3UGS4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mcrip1Q3UGS4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mcrip1Q3UGS4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mcrip1Q3UGS4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mcrip1Q3UGS4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mcrip1Q3UGS4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Mcrip1Q3UGS4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mcrip1Q3UGS4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Mcrip1Q3UGS4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mcrip1Q3UGS4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mcrip1Q3UGS4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mcrip1Q3UGS4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mcrip1Q3UGS4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mcrip1Q3UGS4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mcrip1Q3UGS4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mcrip1Q3UGS4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mcrip1Q3UGS4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mcrip1Q3UGS4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mcrip1Q3UGS4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mcrip1Q3UGS4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mcrip1Q3UGS4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mcrip1Q3UGS4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mcrip1Q3UGS4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mcrip1Q3UGS4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mcrip1Q3UGS4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mcrip1Q3UGS4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Mcrip1Q3UGS4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Mcrip1Q3UGS4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mcrip1Q3UGS4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mcrip1Q3UGS4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mcrip1Q3UGS4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mcrip1Q3UGS4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mcrip1Q3UGS4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mcrip1Q3UGS4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mcrip1Q3UGS4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mcrip1Q3UGS4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mcrip1Q3UGS4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mcrip1Q3UGS4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mcrip1Q3UGS4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mcrip1Q3UGS4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mcrip1Q3UGS4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mcrip1Q3UGS4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mcrip1Q3UGS4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mcrip1Q3UGS4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mcrip1Q3UGS4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mcrip1Q3UGS4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mcrip1Q3UGS4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mcrip1Q3UGS4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mcrip1Q3UGS4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mcrip1Q3UGS4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mcrip1Q3UGS4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mcrip1Q3UGS4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mcrip1Q3UGS4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mcrip1Q3UGS4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mcrip1Q3UGS4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mcrip1Q3UGS4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mcrip1Q3UGS4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mcrip1Q3UGS4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mcrip1Q3UGS4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mcrip1Q3UGS4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mcrip1Q3UGS4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mcrip1Q3UGS4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mcrip1Q3UGS4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mcrip1Q3UGS4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mcrip1Q3UGS4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mcrip1Q3UGS4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Mcrip1Q3UGS4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mcrip1Q3UGS4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mcrip1Q3UGS4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mcrip1Q3UGS4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms