Protein–RNA interactions for Protein: Q3UF64

Rnft2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft2Q3UF64 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rnft2Q3UF64 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rnft2Q3UF64 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnft2Q3UF64 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnft2Q3UF64 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnft2Q3UF64 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnft2Q3UF64 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnft2Q3UF64 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnft2Q3UF64 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnft2Q3UF64 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnft2Q3UF64 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnft2Q3UF64 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnft2Q3UF64 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnft2Q3UF64 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnft2Q3UF64 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnft2Q3UF64 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnft2Q3UF64 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnft2Q3UF64 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnft2Q3UF64 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnft2Q3UF64 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnft2Q3UF64 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnft2Q3UF64 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnft2Q3UF64 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnft2Q3UF64 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnft2Q3UF64 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnft2Q3UF64 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnft2Q3UF64 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnft2Q3UF64 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnft2Q3UF64 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnft2Q3UF64 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnft2Q3UF64 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnft2Q3UF64 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnft2Q3UF64 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnft2Q3UF64 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnft2Q3UF64 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnft2Q3UF64 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnft2Q3UF64 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnft2Q3UF64 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnft2Q3UF64 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnft2Q3UF64 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnft2Q3UF64 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnft2Q3UF64 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnft2Q3UF64 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnft2Q3UF64 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnft2Q3UF64 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnft2Q3UF64 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnft2Q3UF64 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnft2Q3UF64 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnft2Q3UF64 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnft2Q3UF64 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnft2Q3UF64 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnft2Q3UF64 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnft2Q3UF64 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnft2Q3UF64 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rnft2Q3UF64 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rnft2Q3UF64 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnft2Q3UF64 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnft2Q3UF64 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnft2Q3UF64 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnft2Q3UF64 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnft2Q3UF64 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnft2Q3UF64 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnft2Q3UF64 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnft2Q3UF64 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnft2Q3UF64 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnft2Q3UF64 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnft2Q3UF64 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnft2Q3UF64 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnft2Q3UF64 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnft2Q3UF64 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnft2Q3UF64 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnft2Q3UF64 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnft2Q3UF64 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnft2Q3UF64 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnft2Q3UF64 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnft2Q3UF64 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnft2Q3UF64 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnft2Q3UF64 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnft2Q3UF64 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnft2Q3UF64 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnft2Q3UF64 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnft2Q3UF64 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnft2Q3UF64 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnft2Q3UF64 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnft2Q3UF64 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnft2Q3UF64 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnft2Q3UF64 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnft2Q3UF64 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnft2Q3UF64 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnft2Q3UF64 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnft2Q3UF64 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnft2Q3UF64 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnft2Q3UF64 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnft2Q3UF64 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnft2Q3UF64 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnft2Q3UF64 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnft2Q3UF64 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnft2Q3UF64 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnft2Q3UF64 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnft2Q3UF64 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms