Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Puf60Q3UEB3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Puf60Q3UEB3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Puf60Q3UEB3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Puf60Q3UEB3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Puf60Q3UEB3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Puf60Q3UEB3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Puf60Q3UEB3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Puf60Q3UEB3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Puf60Q3UEB3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Puf60Q3UEB3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Puf60Q3UEB3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Puf60Q3UEB3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Puf60Q3UEB3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Puf60Q3UEB3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Puf60Q3UEB3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Puf60Q3UEB3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Puf60Q3UEB3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Puf60Q3UEB3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Puf60Q3UEB3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Puf60Q3UEB3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Puf60Q3UEB3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Puf60Q3UEB3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Puf60Q3UEB3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Puf60Q3UEB3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Puf60Q3UEB3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Puf60Q3UEB3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Puf60Q3UEB3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Puf60Q3UEB3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Puf60Q3UEB3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Puf60Q3UEB3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Puf60Q3UEB3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Puf60Q3UEB3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Puf60Q3UEB3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Puf60Q3UEB3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Puf60Q3UEB3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Puf60Q3UEB3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Puf60Q3UEB3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Puf60Q3UEB3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Puf60Q3UEB3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Puf60Q3UEB3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Puf60Q3UEB3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Puf60Q3UEB3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Puf60Q3UEB3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Puf60Q3UEB3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Puf60Q3UEB3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Puf60Q3UEB3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Puf60Q3UEB3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Puf60Q3UEB3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Puf60Q3UEB3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Puf60Q3UEB3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Puf60Q3UEB3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Puf60Q3UEB3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Puf60Q3UEB3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Puf60Q3UEB3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Puf60Q3UEB3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Puf60Q3UEB3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Puf60Q3UEB3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Puf60Q3UEB3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Puf60Q3UEB3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Puf60Q3UEB3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Puf60Q3UEB3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Puf60Q3UEB3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Puf60Q3UEB3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Puf60Q3UEB3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Puf60Q3UEB3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Puf60Q3UEB3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Puf60Q3UEB3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Puf60Q3UEB3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Puf60Q3UEB3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Puf60Q3UEB3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Puf60Q3UEB3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Puf60Q3UEB3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Puf60Q3UEB3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Puf60Q3UEB3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Puf60Q3UEB3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Puf60Q3UEB3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Puf60Q3UEB3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Puf60Q3UEB3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Puf60Q3UEB3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Puf60Q3UEB3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Puf60Q3UEB3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Puf60Q3UEB3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Puf60Q3UEB3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Puf60Q3UEB3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Puf60Q3UEB3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Puf60Q3UEB3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Puf60Q3UEB3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Puf60Q3UEB3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Puf60Q3UEB3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Puf60Q3UEB3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Puf60Q3UEB3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Puf60Q3UEB3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Puf60Q3UEB3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Puf60Q3UEB3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Puf60Q3UEB3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Puf60Q3UEB3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Puf60Q3UEB3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Puf60Q3UEB3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Puf60Q3UEB3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms