Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDR8

Yipf3, Protein YIPF3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf3Q3UDR8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Yipf3Q3UDR8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Yipf3Q3UDR8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Yipf3Q3UDR8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Yipf3Q3UDR8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Yipf3Q3UDR8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Yipf3Q3UDR8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Yipf3Q3UDR8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Yipf3Q3UDR8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Yipf3Q3UDR8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Yipf3Q3UDR8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Yipf3Q3UDR8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Yipf3Q3UDR8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Yipf3Q3UDR8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Yipf3Q3UDR8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Yipf3Q3UDR8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Yipf3Q3UDR8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Yipf3Q3UDR8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Yipf3Q3UDR8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Yipf3Q3UDR8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Yipf3Q3UDR8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Yipf3Q3UDR8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Yipf3Q3UDR8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Yipf3Q3UDR8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Yipf3Q3UDR8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Yipf3Q3UDR8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Yipf3Q3UDR8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Yipf3Q3UDR8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Yipf3Q3UDR8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Yipf3Q3UDR8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Yipf3Q3UDR8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Yipf3Q3UDR8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Yipf3Q3UDR8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Yipf3Q3UDR8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Yipf3Q3UDR8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Yipf3Q3UDR8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Yipf3Q3UDR8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Yipf3Q3UDR8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Yipf3Q3UDR8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Yipf3Q3UDR8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Yipf3Q3UDR8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Yipf3Q3UDR8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Yipf3Q3UDR8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Yipf3Q3UDR8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Yipf3Q3UDR8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Yipf3Q3UDR8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Yipf3Q3UDR8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Yipf3Q3UDR8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Yipf3Q3UDR8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Yipf3Q3UDR8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Yipf3Q3UDR8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Yipf3Q3UDR8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Yipf3Q3UDR8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Yipf3Q3UDR8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Yipf3Q3UDR8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Yipf3Q3UDR8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Yipf3Q3UDR8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Yipf3Q3UDR8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Yipf3Q3UDR8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Yipf3Q3UDR8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Yipf3Q3UDR8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Yipf3Q3UDR8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Yipf3Q3UDR8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Yipf3Q3UDR8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Yipf3Q3UDR8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Yipf3Q3UDR8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Yipf3Q3UDR8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Yipf3Q3UDR8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Yipf3Q3UDR8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Yipf3Q3UDR8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Yipf3Q3UDR8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Yipf3Q3UDR8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Yipf3Q3UDR8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Yipf3Q3UDR8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Yipf3Q3UDR8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Yipf3Q3UDR8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Yipf3Q3UDR8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Yipf3Q3UDR8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Yipf3Q3UDR8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Yipf3Q3UDR8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Yipf3Q3UDR8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Yipf3Q3UDR8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Yipf3Q3UDR8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Yipf3Q3UDR8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Yipf3Q3UDR8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Yipf3Q3UDR8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Yipf3Q3UDR8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Yipf3Q3UDR8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Yipf3Q3UDR8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Yipf3Q3UDR8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Yipf3Q3UDR8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Yipf3Q3UDR8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Yipf3Q3UDR8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Yipf3Q3UDR8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Yipf3Q3UDR8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Yipf3Q3UDR8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Yipf3Q3UDR8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Yipf3Q3UDR8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Yipf3Q3UDR8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Yipf3Q3UDR8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms