Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trafd1Q3UDK1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trafd1Q3UDK1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trafd1Q3UDK1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trafd1Q3UDK1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trafd1Q3UDK1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trafd1Q3UDK1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trafd1Q3UDK1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trafd1Q3UDK1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trafd1Q3UDK1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trafd1Q3UDK1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trafd1Q3UDK1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trafd1Q3UDK1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trafd1Q3UDK1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trafd1Q3UDK1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trafd1Q3UDK1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Trafd1Q3UDK1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trafd1Q3UDK1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trafd1Q3UDK1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trafd1Q3UDK1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trafd1Q3UDK1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trafd1Q3UDK1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trafd1Q3UDK1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trafd1Q3UDK1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trafd1Q3UDK1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trafd1Q3UDK1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trafd1Q3UDK1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trafd1Q3UDK1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trafd1Q3UDK1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trafd1Q3UDK1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trafd1Q3UDK1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trafd1Q3UDK1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trafd1Q3UDK1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trafd1Q3UDK1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trafd1Q3UDK1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trafd1Q3UDK1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trafd1Q3UDK1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trafd1Q3UDK1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trafd1Q3UDK1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trafd1Q3UDK1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trafd1Q3UDK1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trafd1Q3UDK1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trafd1Q3UDK1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trafd1Q3UDK1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Trafd1Q3UDK1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trafd1Q3UDK1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trafd1Q3UDK1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trafd1Q3UDK1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trafd1Q3UDK1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trafd1Q3UDK1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trafd1Q3UDK1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trafd1Q3UDK1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trafd1Q3UDK1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trafd1Q3UDK1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trafd1Q3UDK1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trafd1Q3UDK1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trafd1Q3UDK1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Trafd1Q3UDK1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trafd1Q3UDK1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trafd1Q3UDK1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Trafd1Q3UDK1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trafd1Q3UDK1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trafd1Q3UDK1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trafd1Q3UDK1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trafd1Q3UDK1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trafd1Q3UDK1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trafd1Q3UDK1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trafd1Q3UDK1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trafd1Q3UDK1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trafd1Q3UDK1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trafd1Q3UDK1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trafd1Q3UDK1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Trafd1Q3UDK1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trafd1Q3UDK1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Trafd1Q3UDK1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trafd1Q3UDK1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trafd1Q3UDK1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trafd1Q3UDK1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trafd1Q3UDK1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trafd1Q3UDK1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trafd1Q3UDK1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trafd1Q3UDK1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trafd1Q3UDK1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trafd1Q3UDK1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trafd1Q3UDK1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trafd1Q3UDK1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trafd1Q3UDK1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Trafd1Q3UDK1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trafd1Q3UDK1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trafd1Q3UDK1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trafd1Q3UDK1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trafd1Q3UDK1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trafd1Q3UDK1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trafd1Q3UDK1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Trafd1Q3UDK1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trafd1Q3UDK1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trafd1Q3UDK1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trafd1Q3UDK1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trafd1Q3UDK1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trafd1Q3UDK1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms