Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBX0

Tmem109, Transmembrane protein 109, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem109Q3UBX0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tmem109Q3UBX0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tmem109Q3UBX0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tmem109Q3UBX0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tmem109Q3UBX0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmem109Q3UBX0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmem109Q3UBX0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmem109Q3UBX0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmem109Q3UBX0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmem109Q3UBX0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmem109Q3UBX0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmem109Q3UBX0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmem109Q3UBX0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmem109Q3UBX0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Tmem109Q3UBX0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Tmem109Q3UBX0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmem109Q3UBX0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmem109Q3UBX0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmem109Q3UBX0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmem109Q3UBX0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmem109Q3UBX0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmem109Q3UBX0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmem109Q3UBX0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmem109Q3UBX0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmem109Q3UBX0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmem109Q3UBX0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmem109Q3UBX0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmem109Q3UBX0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmem109Q3UBX0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmem109Q3UBX0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmem109Q3UBX0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmem109Q3UBX0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmem109Q3UBX0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmem109Q3UBX0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmem109Q3UBX0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmem109Q3UBX0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmem109Q3UBX0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmem109Q3UBX0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmem109Q3UBX0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmem109Q3UBX0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmem109Q3UBX0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmem109Q3UBX0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmem109Q3UBX0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmem109Q3UBX0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmem109Q3UBX0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmem109Q3UBX0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmem109Q3UBX0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmem109Q3UBX0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmem109Q3UBX0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmem109Q3UBX0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmem109Q3UBX0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmem109Q3UBX0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmem109Q3UBX0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmem109Q3UBX0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmem109Q3UBX0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmem109Q3UBX0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmem109Q3UBX0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tmem109Q3UBX0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tmem109Q3UBX0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tmem109Q3UBX0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmem109Q3UBX0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmem109Q3UBX0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmem109Q3UBX0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmem109Q3UBX0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmem109Q3UBX0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmem109Q3UBX0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmem109Q3UBX0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmem109Q3UBX0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmem109Q3UBX0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmem109Q3UBX0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmem109Q3UBX0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmem109Q3UBX0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmem109Q3UBX0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmem109Q3UBX0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmem109Q3UBX0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmem109Q3UBX0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmem109Q3UBX0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmem109Q3UBX0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmem109Q3UBX0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmem109Q3UBX0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmem109Q3UBX0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmem109Q3UBX0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmem109Q3UBX0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmem109Q3UBX0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmem109Q3UBX0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmem109Q3UBX0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmem109Q3UBX0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmem109Q3UBX0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmem109Q3UBX0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmem109Q3UBX0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmem109Q3UBX0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmem109Q3UBX0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmem109Q3UBX0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmem109Q3UBX0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmem109Q3UBX0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmem109Q3UBX0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmem109Q3UBX0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmem109Q3UBX0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmem109Q3UBX0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmem109Q3UBX0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms