Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBG2

Pid1, PTB-containing, cubilin and LRP1-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pid1Q3UBG2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Pid1Q3UBG2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pid1Q3UBG2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pid1Q3UBG2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pid1Q3UBG2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pid1Q3UBG2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pid1Q3UBG2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Pid1Q3UBG2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pid1Q3UBG2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pid1Q3UBG2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pid1Q3UBG2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pid1Q3UBG2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pid1Q3UBG2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pid1Q3UBG2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pid1Q3UBG2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pid1Q3UBG2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Pid1Q3UBG2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pid1Q3UBG2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pid1Q3UBG2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pid1Q3UBG2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pid1Q3UBG2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pid1Q3UBG2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pid1Q3UBG2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pid1Q3UBG2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Pid1Q3UBG2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pid1Q3UBG2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pid1Q3UBG2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pid1Q3UBG2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pid1Q3UBG2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pid1Q3UBG2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pid1Q3UBG2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pid1Q3UBG2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pid1Q3UBG2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pid1Q3UBG2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pid1Q3UBG2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pid1Q3UBG2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pid1Q3UBG2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pid1Q3UBG2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pid1Q3UBG2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pid1Q3UBG2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pid1Q3UBG2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pid1Q3UBG2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pid1Q3UBG2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pid1Q3UBG2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pid1Q3UBG2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pid1Q3UBG2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pid1Q3UBG2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pid1Q3UBG2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pid1Q3UBG2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pid1Q3UBG2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pid1Q3UBG2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pid1Q3UBG2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Pid1Q3UBG2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pid1Q3UBG2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pid1Q3UBG2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pid1Q3UBG2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pid1Q3UBG2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pid1Q3UBG2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pid1Q3UBG2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pid1Q3UBG2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pid1Q3UBG2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pid1Q3UBG2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pid1Q3UBG2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pid1Q3UBG2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pid1Q3UBG2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pid1Q3UBG2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pid1Q3UBG2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pid1Q3UBG2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pid1Q3UBG2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pid1Q3UBG2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pid1Q3UBG2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pid1Q3UBG2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pid1Q3UBG2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pid1Q3UBG2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pid1Q3UBG2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pid1Q3UBG2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pid1Q3UBG2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pid1Q3UBG2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pid1Q3UBG2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pid1Q3UBG2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pid1Q3UBG2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pid1Q3UBG2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pid1Q3UBG2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pid1Q3UBG2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pid1Q3UBG2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pid1Q3UBG2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pid1Q3UBG2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pid1Q3UBG2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Pid1Q3UBG2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pid1Q3UBG2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Pid1Q3UBG2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pid1Q3UBG2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pid1Q3UBG2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pid1Q3UBG2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Pid1Q3UBG2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pid1Q3UBG2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pid1Q3UBG2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pid1Q3UBG2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pid1Q3UBG2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pid1Q3UBG2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms