Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rnf180Q3U827 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rnf180Q3U827 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Rnf180Q3U827 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Rnf180Q3U827 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rnf180Q3U827 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rnf180Q3U827 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rnf180Q3U827 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Rnf180Q3U827 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Rnf180Q3U827 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Rnf180Q3U827 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rnf180Q3U827 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Rnf180Q3U827 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Rnf180Q3U827 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rnf180Q3U827 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rnf180Q3U827 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rnf180Q3U827 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rnf180Q3U827 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rnf180Q3U827 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rnf180Q3U827 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rnf180Q3U827 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rnf180Q3U827 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rnf180Q3U827 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rnf180Q3U827 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rnf180Q3U827 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rnf180Q3U827 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rnf180Q3U827 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rnf180Q3U827 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rnf180Q3U827 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rnf180Q3U827 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Rnf180Q3U827 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rnf180Q3U827 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Rnf180Q3U827 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rnf180Q3U827 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rnf180Q3U827 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Rnf180Q3U827 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Rnf180Q3U827 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rnf180Q3U827 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Rnf180Q3U827 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rnf180Q3U827 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rnf180Q3U827 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rnf180Q3U827 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rnf180Q3U827 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rnf180Q3U827 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rnf180Q3U827 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rnf180Q3U827 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rnf180Q3U827 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rnf180Q3U827 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rnf180Q3U827 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rnf180Q3U827 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rnf180Q3U827 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rnf180Q3U827 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rnf180Q3U827 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Rnf180Q3U827 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Rnf180Q3U827 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rnf180Q3U827 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rnf180Q3U827 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rnf180Q3U827 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rnf180Q3U827 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rnf180Q3U827 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rnf180Q3U827 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rnf180Q3U827 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rnf180Q3U827 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rnf180Q3U827 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rnf180Q3U827 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Rnf180Q3U827 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Rnf180Q3U827 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rnf180Q3U827 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rnf180Q3U827 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Rnf180Q3U827 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rnf180Q3U827 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Rnf180Q3U827 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Rnf180Q3U827 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rnf180Q3U827 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rnf180Q3U827 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rnf180Q3U827 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rnf180Q3U827 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rnf180Q3U827 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rnf180Q3U827 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rnf180Q3U827 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rnf180Q3U827 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rnf180Q3U827 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rnf180Q3U827 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rnf180Q3U827 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rnf180Q3U827 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rnf180Q3U827 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rnf180Q3U827 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rnf180Q3U827 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Rnf180Q3U827 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rnf180Q3U827 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rnf180Q3U827 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rnf180Q3U827 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rnf180Q3U827 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rnf180Q3U827 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rnf180Q3U827 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rnf180Q3U827 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Rnf180Q3U827 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rnf180Q3U827 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rnf180Q3U827 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rnf180Q3U827 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
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