Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S8

Hvcn1, Voltage-gated hydrogen channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hvcn1Q3U2S8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hvcn1Q3U2S8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hvcn1Q3U2S8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hvcn1Q3U2S8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hvcn1Q3U2S8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hvcn1Q3U2S8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hvcn1Q3U2S8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hvcn1Q3U2S8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hvcn1Q3U2S8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hvcn1Q3U2S8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hvcn1Q3U2S8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hvcn1Q3U2S8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hvcn1Q3U2S8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hvcn1Q3U2S8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hvcn1Q3U2S8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hvcn1Q3U2S8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hvcn1Q3U2S8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hvcn1Q3U2S8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hvcn1Q3U2S8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hvcn1Q3U2S8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hvcn1Q3U2S8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hvcn1Q3U2S8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hvcn1Q3U2S8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hvcn1Q3U2S8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hvcn1Q3U2S8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Hvcn1Q3U2S8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hvcn1Q3U2S8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hvcn1Q3U2S8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hvcn1Q3U2S8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hvcn1Q3U2S8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hvcn1Q3U2S8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hvcn1Q3U2S8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hvcn1Q3U2S8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hvcn1Q3U2S8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hvcn1Q3U2S8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hvcn1Q3U2S8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hvcn1Q3U2S8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hvcn1Q3U2S8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hvcn1Q3U2S8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hvcn1Q3U2S8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Hvcn1Q3U2S8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hvcn1Q3U2S8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hvcn1Q3U2S8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hvcn1Q3U2S8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hvcn1Q3U2S8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hvcn1Q3U2S8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hvcn1Q3U2S8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hvcn1Q3U2S8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hvcn1Q3U2S8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hvcn1Q3U2S8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hvcn1Q3U2S8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hvcn1Q3U2S8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hvcn1Q3U2S8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hvcn1Q3U2S8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hvcn1Q3U2S8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hvcn1Q3U2S8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hvcn1Q3U2S8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hvcn1Q3U2S8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hvcn1Q3U2S8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hvcn1Q3U2S8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hvcn1Q3U2S8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hvcn1Q3U2S8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hvcn1Q3U2S8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hvcn1Q3U2S8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Hvcn1Q3U2S8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hvcn1Q3U2S8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Hvcn1Q3U2S8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Hvcn1Q3U2S8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Hvcn1Q3U2S8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hvcn1Q3U2S8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hvcn1Q3U2S8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hvcn1Q3U2S8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hvcn1Q3U2S8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hvcn1Q3U2S8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hvcn1Q3U2S8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hvcn1Q3U2S8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hvcn1Q3U2S8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hvcn1Q3U2S8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hvcn1Q3U2S8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hvcn1Q3U2S8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hvcn1Q3U2S8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hvcn1Q3U2S8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hvcn1Q3U2S8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hvcn1Q3U2S8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hvcn1Q3U2S8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Hvcn1Q3U2S8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hvcn1Q3U2S8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hvcn1Q3U2S8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Hvcn1Q3U2S8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hvcn1Q3U2S8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hvcn1Q3U2S8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hvcn1Q3U2S8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hvcn1Q3U2S8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hvcn1Q3U2S8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hvcn1Q3U2S8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hvcn1Q3U2S8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hvcn1Q3U2S8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hvcn1Q3U2S8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hvcn1Q3U2S8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hvcn1Q3U2S8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms