Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1T9

Dennd1b, DENN domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dennd1bQ3U1T9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dennd1bQ3U1T9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dennd1bQ3U1T9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dennd1bQ3U1T9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dennd1bQ3U1T9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dennd1bQ3U1T9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dennd1bQ3U1T9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dennd1bQ3U1T9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dennd1bQ3U1T9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Dennd1bQ3U1T9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dennd1bQ3U1T9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dennd1bQ3U1T9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dennd1bQ3U1T9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dennd1bQ3U1T9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Dennd1bQ3U1T9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Dennd1bQ3U1T9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dennd1bQ3U1T9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Dennd1bQ3U1T9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dennd1bQ3U1T9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dennd1bQ3U1T9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dennd1bQ3U1T9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dennd1bQ3U1T9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dennd1bQ3U1T9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dennd1bQ3U1T9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dennd1bQ3U1T9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dennd1bQ3U1T9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dennd1bQ3U1T9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dennd1bQ3U1T9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dennd1bQ3U1T9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dennd1bQ3U1T9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dennd1bQ3U1T9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dennd1bQ3U1T9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dennd1bQ3U1T9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dennd1bQ3U1T9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dennd1bQ3U1T9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dennd1bQ3U1T9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dennd1bQ3U1T9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dennd1bQ3U1T9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dennd1bQ3U1T9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dennd1bQ3U1T9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dennd1bQ3U1T9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dennd1bQ3U1T9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Dennd1bQ3U1T9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dennd1bQ3U1T9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dennd1bQ3U1T9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dennd1bQ3U1T9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dennd1bQ3U1T9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dennd1bQ3U1T9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dennd1bQ3U1T9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dennd1bQ3U1T9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dennd1bQ3U1T9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dennd1bQ3U1T9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dennd1bQ3U1T9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dennd1bQ3U1T9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dennd1bQ3U1T9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Dennd1bQ3U1T9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dennd1bQ3U1T9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dennd1bQ3U1T9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dennd1bQ3U1T9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dennd1bQ3U1T9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dennd1bQ3U1T9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dennd1bQ3U1T9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dennd1bQ3U1T9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dennd1bQ3U1T9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dennd1bQ3U1T9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dennd1bQ3U1T9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dennd1bQ3U1T9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dennd1bQ3U1T9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dennd1bQ3U1T9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dennd1bQ3U1T9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dennd1bQ3U1T9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dennd1bQ3U1T9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dennd1bQ3U1T9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dennd1bQ3U1T9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Dennd1bQ3U1T9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dennd1bQ3U1T9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dennd1bQ3U1T9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Dennd1bQ3U1T9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Dennd1bQ3U1T9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Dennd1bQ3U1T9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dennd1bQ3U1T9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dennd1bQ3U1T9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dennd1bQ3U1T9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dennd1bQ3U1T9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dennd1bQ3U1T9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dennd1bQ3U1T9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dennd1bQ3U1T9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dennd1bQ3U1T9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dennd1bQ3U1T9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dennd1bQ3U1T9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dennd1bQ3U1T9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dennd1bQ3U1T9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dennd1bQ3U1T9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dennd1bQ3U1T9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dennd1bQ3U1T9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dennd1bQ3U1T9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dennd1bQ3U1T9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dennd1bQ3U1T9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dennd1bQ3U1T9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dennd1bQ3U1T9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms