Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc174Q3U155 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc174Q3U155 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc174Q3U155 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc174Q3U155 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc174Q3U155 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc174Q3U155 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc174Q3U155 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccdc174Q3U155 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc174Q3U155 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc174Q3U155 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc174Q3U155 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc174Q3U155 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc174Q3U155 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc174Q3U155 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc174Q3U155 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc174Q3U155 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc174Q3U155 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc174Q3U155 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc174Q3U155 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc174Q3U155 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc174Q3U155 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc174Q3U155 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc174Q3U155 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc174Q3U155 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc174Q3U155 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc174Q3U155 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc174Q3U155 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc174Q3U155 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc174Q3U155 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc174Q3U155 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc174Q3U155 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc174Q3U155 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc174Q3U155 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc174Q3U155 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc174Q3U155 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc174Q3U155 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc174Q3U155 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc174Q3U155 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc174Q3U155 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc174Q3U155 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc174Q3U155 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc174Q3U155 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc174Q3U155 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc174Q3U155 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc174Q3U155 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc174Q3U155 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc174Q3U155 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc174Q3U155 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc174Q3U155 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc174Q3U155 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc174Q3U155 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc174Q3U155 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc174Q3U155 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc174Q3U155 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc174Q3U155 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc174Q3U155 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc174Q3U155 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc174Q3U155 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc174Q3U155 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc174Q3U155 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc174Q3U155 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc174Q3U155 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc174Q3U155 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc174Q3U155 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc174Q3U155 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc174Q3U155 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc174Q3U155 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc174Q3U155 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc174Q3U155 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc174Q3U155 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc174Q3U155 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc174Q3U155 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc174Q3U155 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc174Q3U155 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc174Q3U155 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc174Q3U155 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc174Q3U155 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc174Q3U155 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc174Q3U155 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc174Q3U155 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc174Q3U155 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc174Q3U155 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc174Q3U155 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc174Q3U155 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc174Q3U155 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc174Q3U155 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc174Q3U155 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc174Q3U155 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc174Q3U155 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc174Q3U155 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc174Q3U155 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc174Q3U155 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc174Q3U155 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc174Q3U155 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc174Q3U155 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc174Q3U155 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc174Q3U155 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc174Q3U155 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc174Q3U155 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms