Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmem35bQ3U0Y2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmem35bQ3U0Y2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmem35bQ3U0Y2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmem35bQ3U0Y2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmem35bQ3U0Y2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem35bQ3U0Y2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem35bQ3U0Y2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem35bQ3U0Y2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem35bQ3U0Y2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem35bQ3U0Y2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem35bQ3U0Y2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem35bQ3U0Y2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem35bQ3U0Y2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Tmem35bQ3U0Y2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmem35bQ3U0Y2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmem35bQ3U0Y2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmem35bQ3U0Y2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem35bQ3U0Y2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem35bQ3U0Y2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem35bQ3U0Y2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem35bQ3U0Y2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem35bQ3U0Y2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem35bQ3U0Y2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem35bQ3U0Y2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem35bQ3U0Y2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem35bQ3U0Y2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem35bQ3U0Y2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem35bQ3U0Y2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem35bQ3U0Y2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem35bQ3U0Y2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem35bQ3U0Y2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem35bQ3U0Y2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem35bQ3U0Y2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem35bQ3U0Y2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem35bQ3U0Y2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem35bQ3U0Y2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmem35bQ3U0Y2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmem35bQ3U0Y2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmem35bQ3U0Y2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmem35bQ3U0Y2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmem35bQ3U0Y2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmem35bQ3U0Y2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem35bQ3U0Y2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem35bQ3U0Y2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem35bQ3U0Y2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem35bQ3U0Y2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem35bQ3U0Y2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem35bQ3U0Y2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem35bQ3U0Y2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem35bQ3U0Y2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem35bQ3U0Y2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem35bQ3U0Y2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem35bQ3U0Y2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem35bQ3U0Y2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem35bQ3U0Y2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem35bQ3U0Y2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem35bQ3U0Y2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem35bQ3U0Y2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem35bQ3U0Y2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem35bQ3U0Y2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem35bQ3U0Y2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem35bQ3U0Y2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem35bQ3U0Y2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem35bQ3U0Y2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem35bQ3U0Y2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem35bQ3U0Y2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem35bQ3U0Y2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem35bQ3U0Y2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem35bQ3U0Y2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem35bQ3U0Y2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem35bQ3U0Y2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem35bQ3U0Y2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem35bQ3U0Y2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem35bQ3U0Y2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem35bQ3U0Y2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmem35bQ3U0Y2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmem35bQ3U0Y2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmem35bQ3U0Y2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmem35bQ3U0Y2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmem35bQ3U0Y2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmem35bQ3U0Y2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmem35bQ3U0Y2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmem35bQ3U0Y2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmem35bQ3U0Y2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmem35bQ3U0Y2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem35bQ3U0Y2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem35bQ3U0Y2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem35bQ3U0Y2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem35bQ3U0Y2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem35bQ3U0Y2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem35bQ3U0Y2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem35bQ3U0Y2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmem35bQ3U0Y2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmem35bQ3U0Y2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmem35bQ3U0Y2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmem35bQ3U0Y2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmem35bQ3U0Y2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmem35bQ3U0Y2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmem35bQ3U0Y2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.9 ms