Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc9Q3U0M1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc9Q3U0M1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc9Q3U0M1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc9Q3U0M1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc9Q3U0M1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc9Q3U0M1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc9Q3U0M1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc9Q3U0M1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc9Q3U0M1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc9Q3U0M1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc9Q3U0M1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trappc9Q3U0M1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trappc9Q3U0M1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trappc9Q3U0M1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trappc9Q3U0M1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trappc9Q3U0M1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc9Q3U0M1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc9Q3U0M1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc9Q3U0M1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc9Q3U0M1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc9Q3U0M1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc9Q3U0M1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc9Q3U0M1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trappc9Q3U0M1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trappc9Q3U0M1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trappc9Q3U0M1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trappc9Q3U0M1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trappc9Q3U0M1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trappc9Q3U0M1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trappc9Q3U0M1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trappc9Q3U0M1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trappc9Q3U0M1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trappc9Q3U0M1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trappc9Q3U0M1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trappc9Q3U0M1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trappc9Q3U0M1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trappc9Q3U0M1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trappc9Q3U0M1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trappc9Q3U0M1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trappc9Q3U0M1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trappc9Q3U0M1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trappc9Q3U0M1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trappc9Q3U0M1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trappc9Q3U0M1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trappc9Q3U0M1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trappc9Q3U0M1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trappc9Q3U0M1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trappc9Q3U0M1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trappc9Q3U0M1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trappc9Q3U0M1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trappc9Q3U0M1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trappc9Q3U0M1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trappc9Q3U0M1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trappc9Q3U0M1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc9Q3U0M1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc9Q3U0M1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc9Q3U0M1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc9Q3U0M1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc9Q3U0M1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc9Q3U0M1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc9Q3U0M1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc9Q3U0M1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc9Q3U0M1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trappc9Q3U0M1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trappc9Q3U0M1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trappc9Q3U0M1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trappc9Q3U0M1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trappc9Q3U0M1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trappc9Q3U0M1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc9Q3U0M1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc9Q3U0M1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc9Q3U0M1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc9Q3U0M1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc9Q3U0M1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc9Q3U0M1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc9Q3U0M1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc9Q3U0M1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc9Q3U0M1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trappc9Q3U0M1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trappc9Q3U0M1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trappc9Q3U0M1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trappc9Q3U0M1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trappc9Q3U0M1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc9Q3U0M1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc9Q3U0M1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc9Q3U0M1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc9Q3U0M1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc9Q3U0M1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc9Q3U0M1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc9Q3U0M1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc9Q3U0M1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc9Q3U0M1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc9Q3U0M1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc9Q3U0M1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trappc9Q3U0M1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trappc9Q3U0M1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trappc9Q3U0M1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trappc9Q3U0M1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trappc9Q3U0M1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms