Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYU2

Atp13a5, Probable cation-transporting ATPase 13A5, mousemouse

Predictions only

Length 1,216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a5Q3TYU2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp13a5Q3TYU2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Atp13a5Q3TYU2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Atp13a5Q3TYU2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp13a5Q3TYU2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp13a5Q3TYU2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp13a5Q3TYU2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp13a5Q3TYU2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp13a5Q3TYU2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp13a5Q3TYU2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp13a5Q3TYU2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp13a5Q3TYU2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp13a5Q3TYU2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp13a5Q3TYU2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp13a5Q3TYU2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp13a5Q3TYU2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp13a5Q3TYU2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp13a5Q3TYU2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp13a5Q3TYU2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp13a5Q3TYU2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp13a5Q3TYU2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp13a5Q3TYU2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp13a5Q3TYU2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp13a5Q3TYU2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp13a5Q3TYU2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp13a5Q3TYU2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp13a5Q3TYU2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp13a5Q3TYU2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp13a5Q3TYU2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp13a5Q3TYU2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp13a5Q3TYU2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp13a5Q3TYU2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp13a5Q3TYU2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp13a5Q3TYU2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp13a5Q3TYU2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp13a5Q3TYU2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp13a5Q3TYU2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp13a5Q3TYU2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp13a5Q3TYU2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp13a5Q3TYU2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp13a5Q3TYU2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp13a5Q3TYU2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp13a5Q3TYU2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp13a5Q3TYU2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp13a5Q3TYU2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp13a5Q3TYU2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp13a5Q3TYU2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp13a5Q3TYU2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp13a5Q3TYU2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp13a5Q3TYU2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp13a5Q3TYU2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp13a5Q3TYU2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp13a5Q3TYU2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp13a5Q3TYU2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp13a5Q3TYU2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp13a5Q3TYU2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp13a5Q3TYU2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp13a5Q3TYU2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp13a5Q3TYU2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp13a5Q3TYU2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp13a5Q3TYU2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp13a5Q3TYU2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp13a5Q3TYU2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp13a5Q3TYU2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp13a5Q3TYU2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp13a5Q3TYU2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp13a5Q3TYU2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp13a5Q3TYU2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp13a5Q3TYU2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp13a5Q3TYU2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp13a5Q3TYU2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp13a5Q3TYU2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp13a5Q3TYU2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp13a5Q3TYU2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp13a5Q3TYU2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp13a5Q3TYU2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp13a5Q3TYU2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp13a5Q3TYU2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp13a5Q3TYU2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp13a5Q3TYU2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp13a5Q3TYU2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp13a5Q3TYU2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp13a5Q3TYU2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp13a5Q3TYU2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp13a5Q3TYU2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp13a5Q3TYU2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp13a5Q3TYU2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp13a5Q3TYU2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp13a5Q3TYU2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp13a5Q3TYU2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp13a5Q3TYU2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp13a5Q3TYU2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp13a5Q3TYU2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp13a5Q3TYU2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp13a5Q3TYU2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp13a5Q3TYU2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp13a5Q3TYU2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp13a5Q3TYU2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp13a5Q3TYU2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp13a5Q3TYU2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms