Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TchpQ3TVW5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TchpQ3TVW5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TchpQ3TVW5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TchpQ3TVW5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TchpQ3TVW5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TchpQ3TVW5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TchpQ3TVW5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TchpQ3TVW5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TchpQ3TVW5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TchpQ3TVW5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TchpQ3TVW5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TchpQ3TVW5 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TchpQ3TVW5 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TchpQ3TVW5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TchpQ3TVW5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TchpQ3TVW5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TchpQ3TVW5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TchpQ3TVW5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TchpQ3TVW5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TchpQ3TVW5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TchpQ3TVW5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TchpQ3TVW5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TchpQ3TVW5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TchpQ3TVW5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TchpQ3TVW5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TchpQ3TVW5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TchpQ3TVW5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TchpQ3TVW5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TchpQ3TVW5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TchpQ3TVW5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TchpQ3TVW5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TchpQ3TVW5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TchpQ3TVW5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TchpQ3TVW5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TchpQ3TVW5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TchpQ3TVW5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TchpQ3TVW5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TchpQ3TVW5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TchpQ3TVW5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TchpQ3TVW5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TchpQ3TVW5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TchpQ3TVW5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TchpQ3TVW5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TchpQ3TVW5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TchpQ3TVW5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TchpQ3TVW5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TchpQ3TVW5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TchpQ3TVW5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TchpQ3TVW5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TchpQ3TVW5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TchpQ3TVW5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TchpQ3TVW5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TchpQ3TVW5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TchpQ3TVW5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TchpQ3TVW5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TchpQ3TVW5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TchpQ3TVW5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TchpQ3TVW5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TchpQ3TVW5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TchpQ3TVW5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TchpQ3TVW5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TchpQ3TVW5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TchpQ3TVW5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TchpQ3TVW5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TchpQ3TVW5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TchpQ3TVW5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TchpQ3TVW5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TchpQ3TVW5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TchpQ3TVW5 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TchpQ3TVW5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TchpQ3TVW5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TchpQ3TVW5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TchpQ3TVW5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TchpQ3TVW5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TchpQ3TVW5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TchpQ3TVW5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TchpQ3TVW5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TchpQ3TVW5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TchpQ3TVW5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TchpQ3TVW5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TchpQ3TVW5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TchpQ3TVW5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TchpQ3TVW5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TchpQ3TVW5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TchpQ3TVW5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TchpQ3TVW5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TchpQ3TVW5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TchpQ3TVW5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TchpQ3TVW5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TchpQ3TVW5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TchpQ3TVW5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TchpQ3TVW5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TchpQ3TVW5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TchpQ3TVW5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TchpQ3TVW5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TchpQ3TVW5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TchpQ3TVW5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TchpQ3TVW5 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TchpQ3TVW5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms