Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTL0

Uncharacterized protein C3orf38 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTL0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q3TTL0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q3TTL0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q3TTL0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Q3TTL0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q3TTL0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q3TTL0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q3TTL0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q3TTL0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q3TTL0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q3TTL0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q3TTL0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q3TTL0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Q3TTL0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q3TTL0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q3TTL0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q3TTL0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q3TTL0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Q3TTL0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q3TTL0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q3TTL0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q3TTL0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q3TTL0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q3TTL0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q3TTL0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q3TTL0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Q3TTL0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q3TTL0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q3TTL0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q3TTL0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q3TTL0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Q3TTL0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q3TTL0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q3TTL0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q3TTL0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q3TTL0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q3TTL0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q3TTL0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Q3TTL0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q3TTL0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q3TTL0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q3TTL0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q3TTL0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q3TTL0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Q3TTL0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q3TTL0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q3TTL0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q3TTL0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q3TTL0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q3TTL0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q3TTL0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q3TTL0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q3TTL0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q3TTL0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q3TTL0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q3TTL0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q3TTL0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q3TTL0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q3TTL0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q3TTL0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q3TTL0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q3TTL0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q3TTL0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q3TTL0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q3TTL0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q3TTL0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q3TTL0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q3TTL0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q3TTL0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q3TTL0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q3TTL0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q3TTL0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q3TTL0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q3TTL0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q3TTL0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Q3TTL0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Q3TTL0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Q3TTL0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q3TTL0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q3TTL0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q3TTL0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q3TTL0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q3TTL0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q3TTL0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q3TTL0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q3TTL0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q3TTL0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q3TTL0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q3TTL0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q3TTL0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q3TTL0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q3TTL0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q3TTL0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Q3TTL0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
Q3TTL0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3TTL0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3TTL0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3TTL0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3TTL0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3TTL0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.8 ms