Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTH7

1500011B03Rik, RIKEN cDNA 1500011B03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1500011B03RikQ3TTH7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
1500011B03RikQ3TTH7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1500011B03RikQ3TTH7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
1500011B03RikQ3TTH7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1500011B03RikQ3TTH7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
1500011B03RikQ3TTH7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
1500011B03RikQ3TTH7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1500011B03RikQ3TTH7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1500011B03RikQ3TTH7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1500011B03RikQ3TTH7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1500011B03RikQ3TTH7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
1500011B03RikQ3TTH7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1500011B03RikQ3TTH7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
1500011B03RikQ3TTH7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
1500011B03RikQ3TTH7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1500011B03RikQ3TTH7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1500011B03RikQ3TTH7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
1500011B03RikQ3TTH7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1500011B03RikQ3TTH7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1500011B03RikQ3TTH7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1500011B03RikQ3TTH7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1500011B03RikQ3TTH7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1500011B03RikQ3TTH7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
1500011B03RikQ3TTH7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
1500011B03RikQ3TTH7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
1500011B03RikQ3TTH7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
1500011B03RikQ3TTH7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1500011B03RikQ3TTH7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1500011B03RikQ3TTH7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1500011B03RikQ3TTH7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
1500011B03RikQ3TTH7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1500011B03RikQ3TTH7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1500011B03RikQ3TTH7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
1500011B03RikQ3TTH7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1500011B03RikQ3TTH7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1500011B03RikQ3TTH7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1500011B03RikQ3TTH7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
1500011B03RikQ3TTH7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
1500011B03RikQ3TTH7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1500011B03RikQ3TTH7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1500011B03RikQ3TTH7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1500011B03RikQ3TTH7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1500011B03RikQ3TTH7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1500011B03RikQ3TTH7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1500011B03RikQ3TTH7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1500011B03RikQ3TTH7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
1500011B03RikQ3TTH7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1500011B03RikQ3TTH7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1500011B03RikQ3TTH7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1500011B03RikQ3TTH7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
1500011B03RikQ3TTH7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
1500011B03RikQ3TTH7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
1500011B03RikQ3TTH7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1500011B03RikQ3TTH7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1500011B03RikQ3TTH7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1500011B03RikQ3TTH7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1500011B03RikQ3TTH7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
1500011B03RikQ3TTH7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1500011B03RikQ3TTH7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1500011B03RikQ3TTH7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1500011B03RikQ3TTH7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
1500011B03RikQ3TTH7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1500011B03RikQ3TTH7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1500011B03RikQ3TTH7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1500011B03RikQ3TTH7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1500011B03RikQ3TTH7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1500011B03RikQ3TTH7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1500011B03RikQ3TTH7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1500011B03RikQ3TTH7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1500011B03RikQ3TTH7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
1500011B03RikQ3TTH7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1500011B03RikQ3TTH7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1500011B03RikQ3TTH7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
1500011B03RikQ3TTH7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1500011B03RikQ3TTH7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
1500011B03RikQ3TTH7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1500011B03RikQ3TTH7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1500011B03RikQ3TTH7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1500011B03RikQ3TTH7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1500011B03RikQ3TTH7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1500011B03RikQ3TTH7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1500011B03RikQ3TTH7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1500011B03RikQ3TTH7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
1500011B03RikQ3TTH7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1500011B03RikQ3TTH7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
1500011B03RikQ3TTH7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1500011B03RikQ3TTH7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
1500011B03RikQ3TTH7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1500011B03RikQ3TTH7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
1500011B03RikQ3TTH7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1500011B03RikQ3TTH7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1500011B03RikQ3TTH7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
1500011B03RikQ3TTH7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1500011B03RikQ3TTH7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1500011B03RikQ3TTH7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1500011B03RikQ3TTH7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1500011B03RikQ3TTH7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1500011B03RikQ3TTH7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
1500011B03RikQ3TTH7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1500011B03RikQ3TTH7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms