Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTD8

Gm21440, Predicted gene, 20737, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21440Q3TTD8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21440Q3TTD8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21440Q3TTD8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21440Q3TTD8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21440Q3TTD8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21440Q3TTD8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21440Q3TTD8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21440Q3TTD8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21440Q3TTD8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21440Q3TTD8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21440Q3TTD8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21440Q3TTD8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21440Q3TTD8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21440Q3TTD8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21440Q3TTD8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21440Q3TTD8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21440Q3TTD8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21440Q3TTD8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21440Q3TTD8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21440Q3TTD8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21440Q3TTD8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21440Q3TTD8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21440Q3TTD8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21440Q3TTD8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21440Q3TTD8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21440Q3TTD8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21440Q3TTD8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21440Q3TTD8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21440Q3TTD8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21440Q3TTD8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21440Q3TTD8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21440Q3TTD8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21440Q3TTD8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21440Q3TTD8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21440Q3TTD8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21440Q3TTD8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21440Q3TTD8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21440Q3TTD8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21440Q3TTD8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21440Q3TTD8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21440Q3TTD8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21440Q3TTD8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21440Q3TTD8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21440Q3TTD8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm21440Q3TTD8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm21440Q3TTD8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm21440Q3TTD8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21440Q3TTD8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21440Q3TTD8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21440Q3TTD8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21440Q3TTD8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21440Q3TTD8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21440Q3TTD8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21440Q3TTD8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21440Q3TTD8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21440Q3TTD8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21440Q3TTD8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21440Q3TTD8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21440Q3TTD8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21440Q3TTD8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21440Q3TTD8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21440Q3TTD8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21440Q3TTD8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21440Q3TTD8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21440Q3TTD8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21440Q3TTD8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21440Q3TTD8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21440Q3TTD8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21440Q3TTD8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21440Q3TTD8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21440Q3TTD8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21440Q3TTD8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21440Q3TTD8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21440Q3TTD8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21440Q3TTD8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21440Q3TTD8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21440Q3TTD8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21440Q3TTD8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21440Q3TTD8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21440Q3TTD8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21440Q3TTD8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21440Q3TTD8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21440Q3TTD8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21440Q3TTD8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21440Q3TTD8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21440Q3TTD8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21440Q3TTD8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21440Q3TTD8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21440Q3TTD8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21440Q3TTD8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21440Q3TTD8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21440Q3TTD8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21440Q3TTD8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21440Q3TTD8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21440Q3TTD8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21440Q3TTD8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21440Q3TTD8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21440Q3TTD8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21440Q3TTD8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21440Q3TTD8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms