Protein–RNA interactions for Protein: Q3TRM4

Pnpla6, Neuropathy target esterase, mousemouse

Predictions only

Length 1,355 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnpla6Q3TRM4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pnpla6Q3TRM4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pnpla6Q3TRM4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Pnpla6Q3TRM4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pnpla6Q3TRM4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pnpla6Q3TRM4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pnpla6Q3TRM4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pnpla6Q3TRM4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pnpla6Q3TRM4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pnpla6Q3TRM4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pnpla6Q3TRM4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pnpla6Q3TRM4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pnpla6Q3TRM4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pnpla6Q3TRM4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pnpla6Q3TRM4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pnpla6Q3TRM4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pnpla6Q3TRM4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pnpla6Q3TRM4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pnpla6Q3TRM4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pnpla6Q3TRM4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pnpla6Q3TRM4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pnpla6Q3TRM4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pnpla6Q3TRM4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Pnpla6Q3TRM4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Pnpla6Q3TRM4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pnpla6Q3TRM4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pnpla6Q3TRM4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pnpla6Q3TRM4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pnpla6Q3TRM4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pnpla6Q3TRM4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pnpla6Q3TRM4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pnpla6Q3TRM4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pnpla6Q3TRM4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pnpla6Q3TRM4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pnpla6Q3TRM4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pnpla6Q3TRM4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pnpla6Q3TRM4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pnpla6Q3TRM4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pnpla6Q3TRM4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Pnpla6Q3TRM4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pnpla6Q3TRM4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pnpla6Q3TRM4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pnpla6Q3TRM4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pnpla6Q3TRM4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pnpla6Q3TRM4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pnpla6Q3TRM4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pnpla6Q3TRM4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pnpla6Q3TRM4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pnpla6Q3TRM4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pnpla6Q3TRM4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pnpla6Q3TRM4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pnpla6Q3TRM4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Pnpla6Q3TRM4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Pnpla6Q3TRM4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pnpla6Q3TRM4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pnpla6Q3TRM4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pnpla6Q3TRM4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pnpla6Q3TRM4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pnpla6Q3TRM4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pnpla6Q3TRM4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pnpla6Q3TRM4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pnpla6Q3TRM4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pnpla6Q3TRM4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pnpla6Q3TRM4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pnpla6Q3TRM4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Pnpla6Q3TRM4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pnpla6Q3TRM4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pnpla6Q3TRM4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pnpla6Q3TRM4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pnpla6Q3TRM4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pnpla6Q3TRM4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pnpla6Q3TRM4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pnpla6Q3TRM4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pnpla6Q3TRM4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pnpla6Q3TRM4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pnpla6Q3TRM4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pnpla6Q3TRM4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pnpla6Q3TRM4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pnpla6Q3TRM4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Pnpla6Q3TRM4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pnpla6Q3TRM4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pnpla6Q3TRM4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pnpla6Q3TRM4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pnpla6Q3TRM4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pnpla6Q3TRM4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pnpla6Q3TRM4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pnpla6Q3TRM4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pnpla6Q3TRM4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pnpla6Q3TRM4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pnpla6Q3TRM4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Pnpla6Q3TRM4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pnpla6Q3TRM4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pnpla6Q3TRM4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pnpla6Q3TRM4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pnpla6Q3TRM4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Pnpla6Q3TRM4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pnpla6Q3TRM4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pnpla6Q3TRM4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Pnpla6Q3TRM4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pnpla6Q3TRM4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms