Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc102aQ3TMW1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc102aQ3TMW1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc102aQ3TMW1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc102aQ3TMW1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc102aQ3TMW1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc102aQ3TMW1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc102aQ3TMW1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc102aQ3TMW1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc102aQ3TMW1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc102aQ3TMW1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc102aQ3TMW1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc102aQ3TMW1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc102aQ3TMW1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc102aQ3TMW1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc102aQ3TMW1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc102aQ3TMW1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc102aQ3TMW1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc102aQ3TMW1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc102aQ3TMW1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc102aQ3TMW1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc102aQ3TMW1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc102aQ3TMW1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc102aQ3TMW1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc102aQ3TMW1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccdc102aQ3TMW1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc102aQ3TMW1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc102aQ3TMW1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc102aQ3TMW1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc102aQ3TMW1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc102aQ3TMW1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc102aQ3TMW1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc102aQ3TMW1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc102aQ3TMW1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc102aQ3TMW1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc102aQ3TMW1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc102aQ3TMW1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc102aQ3TMW1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc102aQ3TMW1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc102aQ3TMW1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc102aQ3TMW1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc102aQ3TMW1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc102aQ3TMW1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc102aQ3TMW1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc102aQ3TMW1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc102aQ3TMW1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc102aQ3TMW1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc102aQ3TMW1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc102aQ3TMW1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc102aQ3TMW1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc102aQ3TMW1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc102aQ3TMW1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc102aQ3TMW1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc102aQ3TMW1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc102aQ3TMW1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc102aQ3TMW1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc102aQ3TMW1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc102aQ3TMW1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc102aQ3TMW1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc102aQ3TMW1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc102aQ3TMW1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc102aQ3TMW1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc102aQ3TMW1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc102aQ3TMW1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc102aQ3TMW1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc102aQ3TMW1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc102aQ3TMW1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc102aQ3TMW1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc102aQ3TMW1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc102aQ3TMW1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc102aQ3TMW1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc102aQ3TMW1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc102aQ3TMW1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc102aQ3TMW1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc102aQ3TMW1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc102aQ3TMW1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc102aQ3TMW1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc102aQ3TMW1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc102aQ3TMW1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc102aQ3TMW1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc102aQ3TMW1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc102aQ3TMW1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc102aQ3TMW1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc102aQ3TMW1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc102aQ3TMW1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc102aQ3TMW1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc102aQ3TMW1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc102aQ3TMW1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc102aQ3TMW1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc102aQ3TMW1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc102aQ3TMW1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc102aQ3TMW1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc102aQ3TMW1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc102aQ3TMW1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc102aQ3TMW1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc102aQ3TMW1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms