Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RubcnlQ3TD16 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RubcnlQ3TD16 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RubcnlQ3TD16 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RubcnlQ3TD16 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RubcnlQ3TD16 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RubcnlQ3TD16 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RubcnlQ3TD16 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RubcnlQ3TD16 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RubcnlQ3TD16 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RubcnlQ3TD16 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RubcnlQ3TD16 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RubcnlQ3TD16 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RubcnlQ3TD16 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RubcnlQ3TD16 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RubcnlQ3TD16 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RubcnlQ3TD16 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RubcnlQ3TD16 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RubcnlQ3TD16 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RubcnlQ3TD16 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RubcnlQ3TD16 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RubcnlQ3TD16 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RubcnlQ3TD16 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RubcnlQ3TD16 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RubcnlQ3TD16 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RubcnlQ3TD16 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RubcnlQ3TD16 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RubcnlQ3TD16 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RubcnlQ3TD16 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RubcnlQ3TD16 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RubcnlQ3TD16 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RubcnlQ3TD16 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RubcnlQ3TD16 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RubcnlQ3TD16 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RubcnlQ3TD16 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RubcnlQ3TD16 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RubcnlQ3TD16 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RubcnlQ3TD16 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RubcnlQ3TD16 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RubcnlQ3TD16 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RubcnlQ3TD16 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RubcnlQ3TD16 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RubcnlQ3TD16 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RubcnlQ3TD16 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RubcnlQ3TD16 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RubcnlQ3TD16 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RubcnlQ3TD16 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RubcnlQ3TD16 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RubcnlQ3TD16 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RubcnlQ3TD16 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RubcnlQ3TD16 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RubcnlQ3TD16 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RubcnlQ3TD16 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RubcnlQ3TD16 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RubcnlQ3TD16 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RubcnlQ3TD16 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RubcnlQ3TD16 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RubcnlQ3TD16 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RubcnlQ3TD16 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RubcnlQ3TD16 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RubcnlQ3TD16 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RubcnlQ3TD16 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RubcnlQ3TD16 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RubcnlQ3TD16 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RubcnlQ3TD16 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RubcnlQ3TD16 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RubcnlQ3TD16 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RubcnlQ3TD16 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RubcnlQ3TD16 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RubcnlQ3TD16 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RubcnlQ3TD16 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RubcnlQ3TD16 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RubcnlQ3TD16 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RubcnlQ3TD16 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RubcnlQ3TD16 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RubcnlQ3TD16 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RubcnlQ3TD16 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RubcnlQ3TD16 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RubcnlQ3TD16 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RubcnlQ3TD16 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RubcnlQ3TD16 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RubcnlQ3TD16 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RubcnlQ3TD16 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RubcnlQ3TD16 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RubcnlQ3TD16 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RubcnlQ3TD16 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RubcnlQ3TD16 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RubcnlQ3TD16 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RubcnlQ3TD16 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RubcnlQ3TD16 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RubcnlQ3TD16 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RubcnlQ3TD16 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RubcnlQ3TD16 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RubcnlQ3TD16 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RubcnlQ3TD16 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RubcnlQ3TD16 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RubcnlQ3TD16 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RubcnlQ3TD16 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RubcnlQ3TD16 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RubcnlQ3TD16 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms