Protein–RNA interactions for Protein: Q3TC93

Hs1bp3, HCLS1-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hs1bp3Q3TC93 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hs1bp3Q3TC93 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hs1bp3Q3TC93 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hs1bp3Q3TC93 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hs1bp3Q3TC93 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hs1bp3Q3TC93 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hs1bp3Q3TC93 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hs1bp3Q3TC93 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hs1bp3Q3TC93 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hs1bp3Q3TC93 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hs1bp3Q3TC93 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hs1bp3Q3TC93 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hs1bp3Q3TC93 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hs1bp3Q3TC93 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hs1bp3Q3TC93 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hs1bp3Q3TC93 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hs1bp3Q3TC93 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hs1bp3Q3TC93 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hs1bp3Q3TC93 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hs1bp3Q3TC93 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hs1bp3Q3TC93 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hs1bp3Q3TC93 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Hs1bp3Q3TC93 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hs1bp3Q3TC93 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hs1bp3Q3TC93 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hs1bp3Q3TC93 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hs1bp3Q3TC93 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hs1bp3Q3TC93 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hs1bp3Q3TC93 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hs1bp3Q3TC93 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hs1bp3Q3TC93 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hs1bp3Q3TC93 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hs1bp3Q3TC93 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hs1bp3Q3TC93 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hs1bp3Q3TC93 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hs1bp3Q3TC93 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hs1bp3Q3TC93 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hs1bp3Q3TC93 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hs1bp3Q3TC93 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hs1bp3Q3TC93 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hs1bp3Q3TC93 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hs1bp3Q3TC93 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hs1bp3Q3TC93 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hs1bp3Q3TC93 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hs1bp3Q3TC93 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hs1bp3Q3TC93 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hs1bp3Q3TC93 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hs1bp3Q3TC93 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hs1bp3Q3TC93 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hs1bp3Q3TC93 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hs1bp3Q3TC93 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hs1bp3Q3TC93 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hs1bp3Q3TC93 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hs1bp3Q3TC93 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hs1bp3Q3TC93 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hs1bp3Q3TC93 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hs1bp3Q3TC93 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hs1bp3Q3TC93 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hs1bp3Q3TC93 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hs1bp3Q3TC93 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hs1bp3Q3TC93 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hs1bp3Q3TC93 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hs1bp3Q3TC93 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hs1bp3Q3TC93 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Hs1bp3Q3TC93 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Hs1bp3Q3TC93 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Hs1bp3Q3TC93 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Hs1bp3Q3TC93 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Hs1bp3Q3TC93 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Hs1bp3Q3TC93 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hs1bp3Q3TC93 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hs1bp3Q3TC93 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hs1bp3Q3TC93 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hs1bp3Q3TC93 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hs1bp3Q3TC93 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hs1bp3Q3TC93 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hs1bp3Q3TC93 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hs1bp3Q3TC93 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hs1bp3Q3TC93 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hs1bp3Q3TC93 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hs1bp3Q3TC93 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hs1bp3Q3TC93 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Hs1bp3Q3TC93 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hs1bp3Q3TC93 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Hs1bp3Q3TC93 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hs1bp3Q3TC93 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hs1bp3Q3TC93 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hs1bp3Q3TC93 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hs1bp3Q3TC93 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hs1bp3Q3TC93 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hs1bp3Q3TC93 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hs1bp3Q3TC93 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Hs1bp3Q3TC93 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hs1bp3Q3TC93 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hs1bp3Q3TC93 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Hs1bp3Q3TC93 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hs1bp3Q3TC93 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hs1bp3Q3TC93 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hs1bp3Q3TC93 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hs1bp3Q3TC93 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms