Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBL6

Tnfaip8l3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnfaip8l3Q3TBL6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnfaip8l3Q3TBL6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnfaip8l3Q3TBL6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnfaip8l3Q3TBL6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnfaip8l3Q3TBL6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnfaip8l3Q3TBL6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnfaip8l3Q3TBL6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnfaip8l3Q3TBL6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnfaip8l3Q3TBL6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnfaip8l3Q3TBL6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnfaip8l3Q3TBL6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnfaip8l3Q3TBL6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnfaip8l3Q3TBL6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnfaip8l3Q3TBL6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnfaip8l3Q3TBL6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnfaip8l3Q3TBL6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnfaip8l3Q3TBL6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnfaip8l3Q3TBL6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnfaip8l3Q3TBL6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnfaip8l3Q3TBL6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnfaip8l3Q3TBL6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnfaip8l3Q3TBL6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnfaip8l3Q3TBL6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnfaip8l3Q3TBL6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnfaip8l3Q3TBL6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnfaip8l3Q3TBL6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnfaip8l3Q3TBL6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnfaip8l3Q3TBL6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnfaip8l3Q3TBL6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnfaip8l3Q3TBL6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnfaip8l3Q3TBL6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tnfaip8l3Q3TBL6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnfaip8l3Q3TBL6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnfaip8l3Q3TBL6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnfaip8l3Q3TBL6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnfaip8l3Q3TBL6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnfaip8l3Q3TBL6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnfaip8l3Q3TBL6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnfaip8l3Q3TBL6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnfaip8l3Q3TBL6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnfaip8l3Q3TBL6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnfaip8l3Q3TBL6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnfaip8l3Q3TBL6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnfaip8l3Q3TBL6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnfaip8l3Q3TBL6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnfaip8l3Q3TBL6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnfaip8l3Q3TBL6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnfaip8l3Q3TBL6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnfaip8l3Q3TBL6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnfaip8l3Q3TBL6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnfaip8l3Q3TBL6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnfaip8l3Q3TBL6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms