Protein–RNA interactions for Protein: Q3TA59

Jmjd8, JmjC domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd8Q3TA59 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Jmjd8Q3TA59 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Jmjd8Q3TA59 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Jmjd8Q3TA59 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Jmjd8Q3TA59 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Jmjd8Q3TA59 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Jmjd8Q3TA59 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Jmjd8Q3TA59 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Jmjd8Q3TA59 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Jmjd8Q3TA59 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Jmjd8Q3TA59 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Jmjd8Q3TA59 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Jmjd8Q3TA59 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Jmjd8Q3TA59 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Jmjd8Q3TA59 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Jmjd8Q3TA59 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Jmjd8Q3TA59 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Jmjd8Q3TA59 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Jmjd8Q3TA59 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Jmjd8Q3TA59 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Jmjd8Q3TA59 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Jmjd8Q3TA59 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Jmjd8Q3TA59 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Jmjd8Q3TA59 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Jmjd8Q3TA59 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Jmjd8Q3TA59 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Jmjd8Q3TA59 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Jmjd8Q3TA59 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Jmjd8Q3TA59 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Jmjd8Q3TA59 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Jmjd8Q3TA59 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Jmjd8Q3TA59 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Jmjd8Q3TA59 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Jmjd8Q3TA59 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Jmjd8Q3TA59 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Jmjd8Q3TA59 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Jmjd8Q3TA59 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Jmjd8Q3TA59 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Jmjd8Q3TA59 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Jmjd8Q3TA59 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Jmjd8Q3TA59 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Jmjd8Q3TA59 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Jmjd8Q3TA59 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Jmjd8Q3TA59 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Jmjd8Q3TA59 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Jmjd8Q3TA59 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Jmjd8Q3TA59 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Jmjd8Q3TA59 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Jmjd8Q3TA59 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Jmjd8Q3TA59 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Jmjd8Q3TA59 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Jmjd8Q3TA59 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Jmjd8Q3TA59 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Jmjd8Q3TA59 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Jmjd8Q3TA59 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Jmjd8Q3TA59 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Jmjd8Q3TA59 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Jmjd8Q3TA59 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Jmjd8Q3TA59 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Jmjd8Q3TA59 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Jmjd8Q3TA59 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Jmjd8Q3TA59 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Jmjd8Q3TA59 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Jmjd8Q3TA59 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Jmjd8Q3TA59 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Jmjd8Q3TA59 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Jmjd8Q3TA59 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Jmjd8Q3TA59 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Jmjd8Q3TA59 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Jmjd8Q3TA59 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Jmjd8Q3TA59 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Jmjd8Q3TA59 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Jmjd8Q3TA59 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Jmjd8Q3TA59 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Jmjd8Q3TA59 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Jmjd8Q3TA59 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Jmjd8Q3TA59 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Jmjd8Q3TA59 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Jmjd8Q3TA59 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Jmjd8Q3TA59 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Jmjd8Q3TA59 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Jmjd8Q3TA59 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Jmjd8Q3TA59 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Jmjd8Q3TA59 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Jmjd8Q3TA59 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Jmjd8Q3TA59 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Jmjd8Q3TA59 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Jmjd8Q3TA59 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Jmjd8Q3TA59 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Jmjd8Q3TA59 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Jmjd8Q3TA59 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Jmjd8Q3TA59 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Jmjd8Q3TA59 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Jmjd8Q3TA59 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Jmjd8Q3TA59 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Jmjd8Q3TA59 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Jmjd8Q3TA59 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Jmjd8Q3TA59 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Jmjd8Q3TA59 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Jmjd8Q3TA59 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms