Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccbe1Q3MI99 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccbe1Q3MI99 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccbe1Q3MI99 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccbe1Q3MI99 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccbe1Q3MI99 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccbe1Q3MI99 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccbe1Q3MI99 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccbe1Q3MI99 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccbe1Q3MI99 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccbe1Q3MI99 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccbe1Q3MI99 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccbe1Q3MI99 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccbe1Q3MI99 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccbe1Q3MI99 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccbe1Q3MI99 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccbe1Q3MI99 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccbe1Q3MI99 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccbe1Q3MI99 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccbe1Q3MI99 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccbe1Q3MI99 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccbe1Q3MI99 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccbe1Q3MI99 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccbe1Q3MI99 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccbe1Q3MI99 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccbe1Q3MI99 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccbe1Q3MI99 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccbe1Q3MI99 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccbe1Q3MI99 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccbe1Q3MI99 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccbe1Q3MI99 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccbe1Q3MI99 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccbe1Q3MI99 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccbe1Q3MI99 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccbe1Q3MI99 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccbe1Q3MI99 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccbe1Q3MI99 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccbe1Q3MI99 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccbe1Q3MI99 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccbe1Q3MI99 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccbe1Q3MI99 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccbe1Q3MI99 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccbe1Q3MI99 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccbe1Q3MI99 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccbe1Q3MI99 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccbe1Q3MI99 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccbe1Q3MI99 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccbe1Q3MI99 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccbe1Q3MI99 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccbe1Q3MI99 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccbe1Q3MI99 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccbe1Q3MI99 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccbe1Q3MI99 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccbe1Q3MI99 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccbe1Q3MI99 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccbe1Q3MI99 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccbe1Q3MI99 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccbe1Q3MI99 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccbe1Q3MI99 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccbe1Q3MI99 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccbe1Q3MI99 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccbe1Q3MI99 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccbe1Q3MI99 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccbe1Q3MI99 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccbe1Q3MI99 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccbe1Q3MI99 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccbe1Q3MI99 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccbe1Q3MI99 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccbe1Q3MI99 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccbe1Q3MI99 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccbe1Q3MI99 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccbe1Q3MI99 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccbe1Q3MI99 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccbe1Q3MI99 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccbe1Q3MI99 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccbe1Q3MI99 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccbe1Q3MI99 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccbe1Q3MI99 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccbe1Q3MI99 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccbe1Q3MI99 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccbe1Q3MI99 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccbe1Q3MI99 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccbe1Q3MI99 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccbe1Q3MI99 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccbe1Q3MI99 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccbe1Q3MI99 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccbe1Q3MI99 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccbe1Q3MI99 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccbe1Q3MI99 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccbe1Q3MI99 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccbe1Q3MI99 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccbe1Q3MI99 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccbe1Q3MI99 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccbe1Q3MI99 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccbe1Q3MI99 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccbe1Q3MI99 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccbe1Q3MI99 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccbe1Q3MI99 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccbe1Q3MI99 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccbe1Q3MI99 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms