Protein–RNA interactions for Protein: Q3L180

Defa26, Alpha-defensin 26, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa26Q3L180 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Defa26Q3L180 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Defa26Q3L180 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Defa26Q3L180 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Defa26Q3L180 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Defa26Q3L180 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Defa26Q3L180 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Defa26Q3L180 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Defa26Q3L180 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Defa26Q3L180 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Defa26Q3L180 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Defa26Q3L180 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Defa26Q3L180 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Defa26Q3L180 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa26Q3L180 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa26Q3L180 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa26Q3L180 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa26Q3L180 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa26Q3L180 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa26Q3L180 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa26Q3L180 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa26Q3L180 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa26Q3L180 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa26Q3L180 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa26Q3L180 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa26Q3L180 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa26Q3L180 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa26Q3L180 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Defa26Q3L180 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Defa26Q3L180 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Defa26Q3L180 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Defa26Q3L180 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Defa26Q3L180 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Defa26Q3L180 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Defa26Q3L180 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Defa26Q3L180 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa26Q3L180 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa26Q3L180 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa26Q3L180 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa26Q3L180 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa26Q3L180 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa26Q3L180 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa26Q3L180 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa26Q3L180 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa26Q3L180 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa26Q3L180 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa26Q3L180 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa26Q3L180 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa26Q3L180 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa26Q3L180 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa26Q3L180 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa26Q3L180 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa26Q3L180 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Defa26Q3L180 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa26Q3L180 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa26Q3L180 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa26Q3L180 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa26Q3L180 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa26Q3L180 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa26Q3L180 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa26Q3L180 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa26Q3L180 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa26Q3L180 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa26Q3L180 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa26Q3L180 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa26Q3L180 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa26Q3L180 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa26Q3L180 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa26Q3L180 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa26Q3L180 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa26Q3L180 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa26Q3L180 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa26Q3L180 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa26Q3L180 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa26Q3L180 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa26Q3L180 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa26Q3L180 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa26Q3L180 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa26Q3L180 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa26Q3L180 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa26Q3L180 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa26Q3L180 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa26Q3L180 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa26Q3L180 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa26Q3L180 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa26Q3L180 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa26Q3L180 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa26Q3L180 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa26Q3L180 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa26Q3L180 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa26Q3L180 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa26Q3L180 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa26Q3L180 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa26Q3L180 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa26Q3L180 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa26Q3L180 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa26Q3L180 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa26Q3L180 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa26Q3L180 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa26Q3L180 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms