Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2-M3Q31093 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2-M3Q31093 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2-M3Q31093 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2-M3Q31093 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2-M3Q31093 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2-M3Q31093 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2-M3Q31093 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2-M3Q31093 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2-M3Q31093 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2-M3Q31093 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2-M3Q31093 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2-M3Q31093 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2-M3Q31093 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2-M3Q31093 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2-M3Q31093 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2-M3Q31093 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2-M3Q31093 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2-M3Q31093 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2-M3Q31093 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2-M3Q31093 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
H2-M3Q31093 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2-M3Q31093 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2-M3Q31093 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2-M3Q31093 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2-M3Q31093 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2-M3Q31093 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
H2-M3Q31093 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2-M3Q31093 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2-M3Q31093 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2-M3Q31093 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2-M3Q31093 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2-M3Q31093 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2-M3Q31093 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2-M3Q31093 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2-M3Q31093 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2-M3Q31093 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2-M3Q31093 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2-M3Q31093 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2-M3Q31093 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2-M3Q31093 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2-M3Q31093 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2-M3Q31093 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2-M3Q31093 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2-M3Q31093 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2-M3Q31093 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2-M3Q31093 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2-M3Q31093 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2-M3Q31093 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2-M3Q31093 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2-M3Q31093 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2-M3Q31093 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2-M3Q31093 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
H2-M3Q31093 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2-M3Q31093 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2-M3Q31093 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2-M3Q31093 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2-M3Q31093 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
H2-M3Q31093 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
H2-M3Q31093 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
H2-M3Q31093 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
H2-M3Q31093 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
H2-M3Q31093 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
H2-M3Q31093 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
H2-M3Q31093 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
H2-M3Q31093 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
H2-M3Q31093 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
H2-M3Q31093 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
H2-M3Q31093 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
H2-M3Q31093 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
H2-M3Q31093 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
H2-M3Q31093 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
H2-M3Q31093 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
H2-M3Q31093 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
H2-M3Q31093 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
H2-M3Q31093 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
H2-M3Q31093 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
H2-M3Q31093 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
H2-M3Q31093 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
H2-M3Q31093 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
H2-M3Q31093 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
H2-M3Q31093 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
H2-M3Q31093 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
H2-M3Q31093 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
H2-M3Q31093 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
H2-M3Q31093 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
H2-M3Q31093 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
H2-M3Q31093 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
H2-M3Q31093 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
H2-M3Q31093 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
H2-M3Q31093 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
H2-M3Q31093 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
H2-M3Q31093 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
H2-M3Q31093 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
H2-M3Q31093 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
H2-M3Q31093 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2-M3Q31093 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2-M3Q31093 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2-M3Q31093 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2-M3Q31093 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms