Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBE6

Pi4k2a, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pi4k2aQ2TBE6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pi4k2aQ2TBE6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pi4k2aQ2TBE6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pi4k2aQ2TBE6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pi4k2aQ2TBE6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pi4k2aQ2TBE6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pi4k2aQ2TBE6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pi4k2aQ2TBE6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pi4k2aQ2TBE6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pi4k2aQ2TBE6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pi4k2aQ2TBE6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pi4k2aQ2TBE6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pi4k2aQ2TBE6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pi4k2aQ2TBE6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pi4k2aQ2TBE6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pi4k2aQ2TBE6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pi4k2aQ2TBE6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pi4k2aQ2TBE6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pi4k2aQ2TBE6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pi4k2aQ2TBE6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Pi4k2aQ2TBE6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pi4k2aQ2TBE6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pi4k2aQ2TBE6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pi4k2aQ2TBE6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pi4k2aQ2TBE6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pi4k2aQ2TBE6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pi4k2aQ2TBE6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pi4k2aQ2TBE6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pi4k2aQ2TBE6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pi4k2aQ2TBE6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pi4k2aQ2TBE6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pi4k2aQ2TBE6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pi4k2aQ2TBE6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pi4k2aQ2TBE6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pi4k2aQ2TBE6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pi4k2aQ2TBE6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pi4k2aQ2TBE6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pi4k2aQ2TBE6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pi4k2aQ2TBE6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Pi4k2aQ2TBE6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Pi4k2aQ2TBE6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pi4k2aQ2TBE6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pi4k2aQ2TBE6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pi4k2aQ2TBE6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pi4k2aQ2TBE6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pi4k2aQ2TBE6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Pi4k2aQ2TBE6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pi4k2aQ2TBE6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pi4k2aQ2TBE6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pi4k2aQ2TBE6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pi4k2aQ2TBE6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pi4k2aQ2TBE6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pi4k2aQ2TBE6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pi4k2aQ2TBE6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pi4k2aQ2TBE6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pi4k2aQ2TBE6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pi4k2aQ2TBE6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pi4k2aQ2TBE6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pi4k2aQ2TBE6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pi4k2aQ2TBE6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pi4k2aQ2TBE6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pi4k2aQ2TBE6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pi4k2aQ2TBE6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pi4k2aQ2TBE6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pi4k2aQ2TBE6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pi4k2aQ2TBE6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Pi4k2aQ2TBE6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pi4k2aQ2TBE6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pi4k2aQ2TBE6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pi4k2aQ2TBE6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pi4k2aQ2TBE6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pi4k2aQ2TBE6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Pi4k2aQ2TBE6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pi4k2aQ2TBE6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pi4k2aQ2TBE6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pi4k2aQ2TBE6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pi4k2aQ2TBE6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pi4k2aQ2TBE6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pi4k2aQ2TBE6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Pi4k2aQ2TBE6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Pi4k2aQ2TBE6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pi4k2aQ2TBE6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pi4k2aQ2TBE6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pi4k2aQ2TBE6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Pi4k2aQ2TBE6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pi4k2aQ2TBE6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pi4k2aQ2TBE6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pi4k2aQ2TBE6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pi4k2aQ2TBE6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pi4k2aQ2TBE6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pi4k2aQ2TBE6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pi4k2aQ2TBE6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pi4k2aQ2TBE6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pi4k2aQ2TBE6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Pi4k2aQ2TBE6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pi4k2aQ2TBE6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pi4k2aQ2TBE6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Pi4k2aQ2TBE6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pi4k2aQ2TBE6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pi4k2aQ2TBE6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms