Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vax1Q2NKI2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vax1Q2NKI2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vax1Q2NKI2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vax1Q2NKI2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vax1Q2NKI2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vax1Q2NKI2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vax1Q2NKI2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vax1Q2NKI2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vax1Q2NKI2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vax1Q2NKI2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vax1Q2NKI2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Vax1Q2NKI2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vax1Q2NKI2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vax1Q2NKI2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vax1Q2NKI2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vax1Q2NKI2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vax1Q2NKI2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Vax1Q2NKI2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vax1Q2NKI2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vax1Q2NKI2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vax1Q2NKI2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vax1Q2NKI2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Vax1Q2NKI2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vax1Q2NKI2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vax1Q2NKI2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vax1Q2NKI2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vax1Q2NKI2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vax1Q2NKI2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vax1Q2NKI2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vax1Q2NKI2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vax1Q2NKI2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vax1Q2NKI2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vax1Q2NKI2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vax1Q2NKI2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vax1Q2NKI2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vax1Q2NKI2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vax1Q2NKI2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vax1Q2NKI2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vax1Q2NKI2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vax1Q2NKI2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vax1Q2NKI2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vax1Q2NKI2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vax1Q2NKI2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vax1Q2NKI2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vax1Q2NKI2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vax1Q2NKI2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vax1Q2NKI2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vax1Q2NKI2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vax1Q2NKI2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Vax1Q2NKI2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vax1Q2NKI2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vax1Q2NKI2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vax1Q2NKI2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vax1Q2NKI2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vax1Q2NKI2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vax1Q2NKI2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vax1Q2NKI2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vax1Q2NKI2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vax1Q2NKI2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vax1Q2NKI2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vax1Q2NKI2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vax1Q2NKI2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vax1Q2NKI2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Vax1Q2NKI2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vax1Q2NKI2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vax1Q2NKI2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vax1Q2NKI2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vax1Q2NKI2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vax1Q2NKI2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vax1Q2NKI2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vax1Q2NKI2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vax1Q2NKI2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vax1Q2NKI2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vax1Q2NKI2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vax1Q2NKI2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vax1Q2NKI2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vax1Q2NKI2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vax1Q2NKI2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vax1Q2NKI2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Vax1Q2NKI2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vax1Q2NKI2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vax1Q2NKI2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vax1Q2NKI2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vax1Q2NKI2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vax1Q2NKI2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vax1Q2NKI2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Vax1Q2NKI2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vax1Q2NKI2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vax1Q2NKI2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vax1Q2NKI2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vax1Q2NKI2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vax1Q2NKI2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vax1Q2NKI2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vax1Q2NKI2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vax1Q2NKI2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vax1Q2NKI2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Vax1Q2NKI2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vax1Q2NKI2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vax1Q2NKI2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms