Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3X8

Phactr1, Phosphatase and actin regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phactr1Q2M3X8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Phactr1Q2M3X8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Phactr1Q2M3X8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Phactr1Q2M3X8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Phactr1Q2M3X8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Phactr1Q2M3X8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Phactr1Q2M3X8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Phactr1Q2M3X8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Phactr1Q2M3X8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Phactr1Q2M3X8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Phactr1Q2M3X8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Phactr1Q2M3X8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Phactr1Q2M3X8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Phactr1Q2M3X8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Phactr1Q2M3X8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Phactr1Q2M3X8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Phactr1Q2M3X8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Phactr1Q2M3X8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Phactr1Q2M3X8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Phactr1Q2M3X8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Phactr1Q2M3X8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Phactr1Q2M3X8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Phactr1Q2M3X8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Phactr1Q2M3X8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Phactr1Q2M3X8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phactr1Q2M3X8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phactr1Q2M3X8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phactr1Q2M3X8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phactr1Q2M3X8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phactr1Q2M3X8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phactr1Q2M3X8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Phactr1Q2M3X8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Phactr1Q2M3X8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Phactr1Q2M3X8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Phactr1Q2M3X8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Phactr1Q2M3X8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Phactr1Q2M3X8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Phactr1Q2M3X8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Phactr1Q2M3X8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Phactr1Q2M3X8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Phactr1Q2M3X8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Phactr1Q2M3X8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Phactr1Q2M3X8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Phactr1Q2M3X8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Phactr1Q2M3X8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Phactr1Q2M3X8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Phactr1Q2M3X8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Phactr1Q2M3X8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Phactr1Q2M3X8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Phactr1Q2M3X8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Phactr1Q2M3X8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Phactr1Q2M3X8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Phactr1Q2M3X8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Phactr1Q2M3X8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Phactr1Q2M3X8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Phactr1Q2M3X8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Phactr1Q2M3X8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Phactr1Q2M3X8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Phactr1Q2M3X8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Phactr1Q2M3X8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phactr1Q2M3X8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Phactr1Q2M3X8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phactr1Q2M3X8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phactr1Q2M3X8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phactr1Q2M3X8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phactr1Q2M3X8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phactr1Q2M3X8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phactr1Q2M3X8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phactr1Q2M3X8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phactr1Q2M3X8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phactr1Q2M3X8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phactr1Q2M3X8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phactr1Q2M3X8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phactr1Q2M3X8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phactr1Q2M3X8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phactr1Q2M3X8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phactr1Q2M3X8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phactr1Q2M3X8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phactr1Q2M3X8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phactr1Q2M3X8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phactr1Q2M3X8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phactr1Q2M3X8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phactr1Q2M3X8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phactr1Q2M3X8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phactr1Q2M3X8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phactr1Q2M3X8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phactr1Q2M3X8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phactr1Q2M3X8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phactr1Q2M3X8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Phactr1Q2M3X8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phactr1Q2M3X8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phactr1Q2M3X8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phactr1Q2M3X8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Phactr1Q2M3X8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phactr1Q2M3X8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phactr1Q2M3X8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phactr1Q2M3X8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Phactr1Q2M3X8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phactr1Q2M3X8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phactr1Q2M3X8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms