Protein–RNA interactions for Protein: Q208S0

Teddm2, Epididymal protein Me9, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Teddm2Q208S0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Teddm2Q208S0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Teddm2Q208S0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Teddm2Q208S0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Teddm2Q208S0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Teddm2Q208S0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Teddm2Q208S0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Teddm2Q208S0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Teddm2Q208S0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Teddm2Q208S0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Teddm2Q208S0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Teddm2Q208S0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Teddm2Q208S0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Teddm2Q208S0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Teddm2Q208S0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Teddm2Q208S0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Teddm2Q208S0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Teddm2Q208S0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Teddm2Q208S0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Teddm2Q208S0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Teddm2Q208S0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Teddm2Q208S0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Teddm2Q208S0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Teddm2Q208S0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Teddm2Q208S0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Teddm2Q208S0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Teddm2Q208S0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Teddm2Q208S0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Teddm2Q208S0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Teddm2Q208S0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Teddm2Q208S0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Teddm2Q208S0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Teddm2Q208S0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Teddm2Q208S0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Teddm2Q208S0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Teddm2Q208S0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Teddm2Q208S0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Teddm2Q208S0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Teddm2Q208S0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Teddm2Q208S0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Teddm2Q208S0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Teddm2Q208S0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Teddm2Q208S0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Teddm2Q208S0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Teddm2Q208S0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Teddm2Q208S0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Teddm2Q208S0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Teddm2Q208S0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Teddm2Q208S0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Teddm2Q208S0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Teddm2Q208S0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Teddm2Q208S0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Teddm2Q208S0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Teddm2Q208S0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Teddm2Q208S0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Teddm2Q208S0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Teddm2Q208S0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Teddm2Q208S0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Teddm2Q208S0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Teddm2Q208S0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Teddm2Q208S0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Teddm2Q208S0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Teddm2Q208S0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Teddm2Q208S0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Teddm2Q208S0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Teddm2Q208S0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Teddm2Q208S0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Teddm2Q208S0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Teddm2Q208S0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Teddm2Q208S0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Teddm2Q208S0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Teddm2Q208S0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Teddm2Q208S0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Teddm2Q208S0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Teddm2Q208S0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Teddm2Q208S0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Teddm2Q208S0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Teddm2Q208S0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Teddm2Q208S0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Teddm2Q208S0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Teddm2Q208S0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Teddm2Q208S0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Teddm2Q208S0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Teddm2Q208S0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Teddm2Q208S0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Teddm2Q208S0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Teddm2Q208S0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Teddm2Q208S0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Teddm2Q208S0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Teddm2Q208S0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Teddm2Q208S0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Teddm2Q208S0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Teddm2Q208S0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Teddm2Q208S0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Teddm2Q208S0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Teddm2Q208S0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Teddm2Q208S0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Teddm2Q208S0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Teddm2Q208S0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Teddm2Q208S0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms