Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Shroom4Q1W617 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Shroom4Q1W617 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Shroom4Q1W617 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
Shroom4Q1W617 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Shroom4Q1W617 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Shroom4Q1W617 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Shroom4Q1W617 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Shroom4Q1W617 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Shroom4Q1W617 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Shroom4Q1W617 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Shroom4Q1W617 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Shroom4Q1W617 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Shroom4Q1W617 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Shroom4Q1W617 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Shroom4Q1W617 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Shroom4Q1W617 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Shroom4Q1W617 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Shroom4Q1W617 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Shroom4Q1W617 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Shroom4Q1W617 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Shroom4Q1W617 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Shroom4Q1W617 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Shroom4Q1W617 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Shroom4Q1W617 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Shroom4Q1W617 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Shroom4Q1W617 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Shroom4Q1W617 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
Shroom4Q1W617 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Shroom4Q1W617 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Shroom4Q1W617 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Shroom4Q1W617 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
Shroom4Q1W617 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Shroom4Q1W617 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Shroom4Q1W617 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
Shroom4Q1W617 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
Shroom4Q1W617 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Shroom4Q1W617 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Shroom4Q1W617 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Shroom4Q1W617 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Shroom4Q1W617 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Shroom4Q1W617 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Shroom4Q1W617 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Shroom4Q1W617 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Shroom4Q1W617 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Shroom4Q1W617 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Shroom4Q1W617 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Shroom4Q1W617 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Shroom4Q1W617 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Shroom4Q1W617 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Shroom4Q1W617 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Shroom4Q1W617 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Shroom4Q1W617 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Shroom4Q1W617 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Shroom4Q1W617 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Shroom4Q1W617 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Shroom4Q1W617 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Shroom4Q1W617 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Shroom4Q1W617 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Shroom4Q1W617 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Shroom4Q1W617 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
Shroom4Q1W617 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Shroom4Q1W617 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Shroom4Q1W617 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Shroom4Q1W617 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
Shroom4Q1W617 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Shroom4Q1W617 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Shroom4Q1W617 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Shroom4Q1W617 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Shroom4Q1W617 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Shroom4Q1W617 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Shroom4Q1W617 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Shroom4Q1W617 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Shroom4Q1W617 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Shroom4Q1W617 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Shroom4Q1W617 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Shroom4Q1W617 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
Shroom4Q1W617 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
Shroom4Q1W617 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
Shroom4Q1W617 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Shroom4Q1W617 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.04
Shroom4Q1W617 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.04
Shroom4Q1W617 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Shroom4Q1W617 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Shroom4Q1W617 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Shroom4Q1W617 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Shroom4Q1W617 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Shroom4Q1W617 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Shroom4Q1W617 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Shroom4Q1W617 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Shroom4Q1W617 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC34■■■■□ 3.03
Shroom4Q1W617 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Shroom4Q1W617 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Shroom4Q1W617 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Shroom4Q1W617 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Shroom4Q1W617 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Shroom4Q1W617 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Shroom4Q1W617 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Shroom4Q1W617 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Shroom4Q1W617 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
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