Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ptchd1Q14B62 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ptchd1Q14B62 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ptchd1Q14B62 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ptchd1Q14B62 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ptchd1Q14B62 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ptchd1Q14B62 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ptchd1Q14B62 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ptchd1Q14B62 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ptchd1Q14B62 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ptchd1Q14B62 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ptchd1Q14B62 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ptchd1Q14B62 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ptchd1Q14B62 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ptchd1Q14B62 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ptchd1Q14B62 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ptchd1Q14B62 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ptchd1Q14B62 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ptchd1Q14B62 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ptchd1Q14B62 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ptchd1Q14B62 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ptchd1Q14B62 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ptchd1Q14B62 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ptchd1Q14B62 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ptchd1Q14B62 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ptchd1Q14B62 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ptchd1Q14B62 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ptchd1Q14B62 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ptchd1Q14B62 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ptchd1Q14B62 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ptchd1Q14B62 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ptchd1Q14B62 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ptchd1Q14B62 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ptchd1Q14B62 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ptchd1Q14B62 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ptchd1Q14B62 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ptchd1Q14B62 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ptchd1Q14B62 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ptchd1Q14B62 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ptchd1Q14B62 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ptchd1Q14B62 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ptchd1Q14B62 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ptchd1Q14B62 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ptchd1Q14B62 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ptchd1Q14B62 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ptchd1Q14B62 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ptchd1Q14B62 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ptchd1Q14B62 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ptchd1Q14B62 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ptchd1Q14B62 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ptchd1Q14B62 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ptchd1Q14B62 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ptchd1Q14B62 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ptchd1Q14B62 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ptchd1Q14B62 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ptchd1Q14B62 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ptchd1Q14B62 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ptchd1Q14B62 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ptchd1Q14B62 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ptchd1Q14B62 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ptchd1Q14B62 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ptchd1Q14B62 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ptchd1Q14B62 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ptchd1Q14B62 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ptchd1Q14B62 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ptchd1Q14B62 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ptchd1Q14B62 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ptchd1Q14B62 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ptchd1Q14B62 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ptchd1Q14B62 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ptchd1Q14B62 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ptchd1Q14B62 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ptchd1Q14B62 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ptchd1Q14B62 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ptchd1Q14B62 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ptchd1Q14B62 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ptchd1Q14B62 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ptchd1Q14B62 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ptchd1Q14B62 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ptchd1Q14B62 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ptchd1Q14B62 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ptchd1Q14B62 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ptchd1Q14B62 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ptchd1Q14B62 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ptchd1Q14B62 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ptchd1Q14B62 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ptchd1Q14B62 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ptchd1Q14B62 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ptchd1Q14B62 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ptchd1Q14B62 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ptchd1Q14B62 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ptchd1Q14B62 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ptchd1Q14B62 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ptchd1Q14B62 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ptchd1Q14B62 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ptchd1Q14B62 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ptchd1Q14B62 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ptchd1Q14B62 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ptchd1Q14B62 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ptchd1Q14B62 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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